Introduction
L'utilisation des phages comme thérapie
nécessite plusieurs étapes de caractérisation biologique
et génomique . Après l'isolement et la purification des phages,
le matériel génétique est extrait afin de réaliser
le typage moléculaire par l'utilisation des enzymes de restrictions dans
le but de vérifier le type de matériel génétique,
la technique d'électrophorèse en champs pulsé (PFGE en
anglais) pour voir le profil génomique, la PCR et le séquencage
pour étudier les gènes par comparaison avec d'autres
séquences d'ADN , le séquencage du génome complet par la
technique la technique de Next Generation Sequencing (NGS), etc.
En Côte d'Ivoire, la phagothérapie n'est pas
utilisée comme thérapie et reste méconnue par le corps
médical professionnel (Ehui et al., 2017).
Plusieurs études récentes ont mis en évidence
l'isolement de phages lytiques à potentiel thérapeutique en
Côte d'Ivoire (Essoh et al., 2015 ; Ngazoa-Kakou et
al., 2017) mais aucune application n'a été
explorée. Vue l'émergence des bactéries et
bactéries multi-resistantes dans l'environnement (Baguy, 2014),
la sélection et la caractérisation de phages candidats
potentiels en faveur de la phagothérapie et la mise en place des
biocollections de phages lytiques en Cote d'Ivoire devient une
nécessité et une urgence scientifique.
Aujourd'hui, grâce à la biologie
moléculaire et au séquençage du génome viral, on
peut rapidement éliminer les phages contenant des séquences
génomiques potentiellement dangereuses (gènes de toxines,
gènes de virulence, gène de résistance aux antibiotiques
etc.) (Gorski et al., 2009).
Aussi, ce travail se propose comme objectif général
de :
Déterminer le profil génomique de quelques
phages isolées en Côte d'Ivoire, et comme objectifs
spécifiques de :
? Déterminer le type de matériel
génétique après digestion enzymatique suivie d'une
électrophorèse,
? Estimer la taille du génome par analyse du profil
génomique via la technique de l'électrophorèse en champ
pulsé (PFGE).
.
Revue bibliographique
3
Revue bibliographique
1. Bactériophages
1.1. Définition
Les bactériophages, communément appelés
phages sont des parasites obligatoires n'ayant aucune activité
biochimique à l'extérieur d'une cellule et n'infectent que les
bactéries (Ackermann et DuBow, 1987 ; Kutter et Sulakvelidze,
2005). Ils sont généralement spécifiques à
une espèce bactérienne voire à juste certains individus de
cette espèce. Mais, plusieurs bactériophages peuvent être
spécifiques d'une même bactérie (Sulakvelidze,
2011).
Bien que parasites obligatoires, constitués d'un acide
nucléique (ADN ou ARN) et de protéines, comme tous les virus, ce
ne sont pas des êtres vivants au sens strict, mais des entités
biologiques (Drouji, 2009).
| 
