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Surveillance des infections nosocomiales en pédiatrie au CHU Béni Messous Alger


par Anis Saidoun
Faculté de médecine d'Alger  - Doctorat en pharmacie 2020
  

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République Algérienne Démocratique et Populaire

Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique

Université d'Alger Centre

Faculté de Médecine d'ALGER Département de PHARMACIE

SURVEILLANCE DES INFECTIONS NOSOCOMIALES EN
PEDIATRIE AU CHU BENI MESSOUS

Session : 2019/2020

Présenté par : Le : 28/10/2020

Mohamed Anis SAIDOUNE

Encadré par :

Pr D. TOUATI

(Professeur en Microbiologie clinique)

Devant le Jury :

Président du jury : Professeur KEZZAL

Examinateurs : Professeur TALI MAAMAR

Docteur HAMIDI

À la mémoire des enfants malades décédés lors

de cette étude

« Ce qui est le plus fondamental, c'est que les gens connaissent la vérité plutôt que ma propre justification. Une société saine devrait se faire à plusieurs voix »

Docteur Li Wenliang, médecin et lanceur d'alerte Chinois, harcelé par les autorités pour « diffusion de rumeurs démoralisantes »

Il est décédé du Covid-19, virus contre lequel il avait mis en garde l'opinion publique internationale.

Nous tenions à lui rendre hommage et à lui dire que :

« Si l'humain est ingrat, l'humanité est reconnaissante »

A ces professeurs qui nous ont donné le goût des choses. Et à ma promotrice qui m'a (re)donné le goût de la microbiologie clinique.

Citation d'Isaac Newton, en parlant de ses enseignants :

« Si j'ai pu voir plus loin, c'est que je me tenais sur les épaules de

géants »

À la mémoire de mon grand père, dont l'amour m'a sauvé de la prématurité émotionnelle « Tu n'es plus là où tu étais mais tu es partout où je suis » ;

À mes parents, à qui je dois mes « facteurs de virulence » ;

À Hanifa et Layali, à qui je dédie mes succès et auprès de qui j'oublie mes défaites ;

À ces « fluctuat nec mergitur » que sont mes amis ; M.Ali, H.Jughurta, F. Louisa, S. Anne-Claire, R.Djidjik ;

À tonton et tata Kridi, pour leur hospitalité de Pachas.

Aphorisme attribué à Hippocrate ; C'est le premier principe

de prudence appris aux étudiants en sciences médicales.

« Primum non nocere »

« Avant tout, ne pas nuire »

Plan

Liste des abréviations 7

Liste des figures 8

Liste des tableaux 9

Introduction et objectifs 10

I. Chapitre I : 13

I.1. Définition(s) des infections nosocomiales : 14

I.2. Modes de transmission : 15

I.3. Types d'infections nosocomiales 16

I.3.1. Les Infections urinaires 16

I.3.2. Infections du site opératoire 16

I.3.3. Infections pulmonaires nosocomiales 17

I.3.4. Bactériémies / Fongémies : 18

I.3.5. Les infections liées aux cathéters : 19

I.3.6. Autres infections nosocomiales 21

I.4. Les Facteurs de risque des IN 23

I.5. Les micro-organismes nosocomiaux 24

I.5.1. Bactéries 25

I.5.2. Parasites et champignons 27

I.5.3. Virus 27

I.6. Epidémiologie des IN 28

I.7. Aspects réglementaires : 33

II. Chapitre II : 35

II.1. Matériel et méthodes : 37

II.1.1. Matériel : 37

II.1.2. Méthodes : 38

II.1.2.1. Recueil de données : 38

II.1.2.2. Description des lieux de l'étude 38

II.1.2.3. Le déroulement de la surveillance : 41

II.1.2.4. Logigrammes de prise en charge des prélèvements au laboratoire de microbiologie : 42

III. Chapitre III : 47

III.1. Résultats : 48

III.1.1. Résultats par phase : 48

III.1.1.1. Épisode de surveillance numéro 1 : 48

III.1.1.2. Épisode de surveillance numéro 2 : 49

III.1.1.3. Épisode de surveillance numéro 3 : 51

III.1.2. La variation de la prévalence des infections nosocomiales durant l'étude 52

III.1.3. Résultats des trois épisodes de surveillance des IN : 54

III.2. Commentaires et discussion : 61

Conclusion 68

Recommandations et mesures correctives 70

Références Bibliographiques 75

Annexes 78

Liste des abréviations

· °C : Degré Celsius

· ABRI : Acinetobacter baumannii Résistant à l'Imipénème

· BHRe : Bactérie Hautement Résistante émergente

· BGN : Bacilles Gram Négatif

· BLSE : Bêtalactamases à Spectre Elargi

· BMR : Bactérie Multi-Résistante

· CDC : Center for Disease Control and prevention

· CHU : Centre Hospitalo-Universitaire

· CLIN : Comité de Lutte contre les Infections Nosocomiales

· CMV : Cytomégalovirus

· CPAP : Continuos Positive Airway Pressure

· CTINILS : Comité Technique des Infections Nosocomiales et des Infections Liées aux Soins

· CVC : Cathéter Veineux Périphérique

· DASRI : Déchets d'activités de soins à risques infectieux et assimilés

· E-BLSE : Entérobactéries productrices de bêtalactamases à spectre élargi

· ERV : Enterococcus faecium résistant à la Vancomycine

· GB : Globules Blancs

· GN : Gélose Nutritive

· HUG : Hôpitaux Universitaires de Genève

· IAS : Infection(s) associée(s) aux Soins

· ILC : Infection Liée au Cathéter

· IN : Infection(s) nosocomiale(s)

· KES : Klebsiella, Enterobacter, Serratia

· KP : Klebsiella pneumoniae

· MMH : Maladie des Membranes Hyalines

· MSP : Ministère de la Santé Publique

· lNHSN : National Healthcare Safety Network

· OMS : Organisation Mondiale de la Santé

· ORL : Otto, Rhino, Laryngo

· PARC : Pseudomonas aeruginosa résistant à la Ceftazidime

· PAVM : Pneumopathie Associée à la Ventilation Mécanique

· SARM : Staphylococcus aureus résistant à la Méthicilline

· SCN : Staphylocoque à Coagulase Négative

· SHA : Solution Hydro-Alcoolique

· UFC : Unit Forming Colony

· USI : Unité de Soins Intensifs

· VM : Ventilation Mécanique

· VNI : Ventilation Non Invasive

· VRS : Virus Respiratoire Syncytial

Liste des figures

Figure 1 - La surveillance des infections nosocomiales : un processus circulaire. 30

Figure 2 - ARRÊTÉ N°64 MSP DU 17/11/1998 PORTANT CREATION D'UN COMITE DE LUTTE CONTRE LES INFECTIONS NOSOCOMIALES AU NIVEAU DES

ETABLISSEMENTS DE SANTE. 33

Figure 3 - CHU Béni Messous 38

Figure 4 - Plan du service de pédiatrie du CHU Beni Messous 39

Figure 5 - Logigramme de prise en charge des prélèvements profonds au laboratoire de

microbiologie. 42

Figure 6 - Logigramme de prise en charge des hémocultures au laboratoire de microbiologie. 43

Figure 7 - Logigramme de prise en charge des prélèvements urinaires au laboratoire de

microbiologie. 44
Figure 8 - Logigramme de prise en charge des prélèvements superficiels au laboratoire de

microbiologie. 45

Figure 9 - Répartition selon le type d'infection durant la phase I. 48

Figure 10 - Répartition selon le type de micro-organismes isolés durant la phase I. 49

Figure 11 - Répartition selon le type d'infection durant la phase II. 50

Figure 12 - Répartition selon le type de micro-organismes isolés durant la phase II. 50

Figure 13 - Répartition selon le type d'infections durant la phase III. 51

Figure 14 - Répartition selon le type de micro-organismes isolés durant la phase III. 51

Figure 15- Variation de la prévalence moyenne en pédiatrie durant les trois enquêtes. 52

Figure 16 - Variation de la prévalence moyenne à l'unité Mussy durant les trois enquêtes. 52

Figure 17 - Variation de la prévalence moyenne à l'unité de soins intensifs (Nobecourt) durant les

trois enquêtes 53
Figure 18 - Variation de la prévalence moyenne à l'unité de Néonatologie (Nobecourt) durant les

trois enquêtes 53

Figure 19 - Distribution des patients infectés selon la tranche d'âge. 55

Figure 20 - Répartition selon le nombre d'infections contractées par le même malade 55

Figure 21- Répartition selon le type de micro-organismes isolés durant l'étude. 56

Figure 22 - Répartition des micro-organismes isolés durant l'étude par familles. 56

Figure 23 - Micro-organismes isolés durant l'étude par espèce. 57

Figure 24 - Consommation en SHA du service de Pédiatrie durant les mois de Janvier, Février et

Mars selon la pharmacie du CHU. 60

Figure 25 - Exemples de plaques signalétiques au lit du patient 72

Figure 26 - Photos d'infections cutanées nosocomiales contractées à l'unité Mussy 82

Figure 27 - Enterococcus faecium multirésistant retrouvé en pédiatrie durant la pré-enquête sur un

prélèvement d'abcès péri-anal. 83

Figure 28 - Corrélation consommation en antibiotiques et résistance [30] 84

Liste des tableaux

Tableau 1 - Liste de BMR/BHRe 27

Tableau 2 - Indicateurs de fréquence des infections nosocomiales [4] 29

Tableau 3 - Levures dans un examen direct à l'état frais 46

Tableau 4 - Bourgeonnement caractéristique des levures du genre Candida 46

Tableau 5- Candida albicans test de blastèse 46

Tableau 6 - Motifs d'hospitalisation des patients suivis. 54

Tableau 7 - Tableau récapitulatif. 58

Tableau 8 - Stratification des IN suivant le risque infectieux selon guide pratique de lutte contre les

infections nosocomiales de l'OMS. 74

Introduction et objectifs

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"Nous voulons explorer la bonté contrée énorme où tout se tait"   Appolinaire