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Comparaison de trois tests de détection rapide des β-lactamases à spectre elargi dans les échantillons d’hémocultures et d’urines


par Hervé KAFANDO
Université Joseph Ki-Zerbo - DES de biologie clinique 2019
  

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Chapitre 1 : Résistance bactérienne aux antibiotiques

1. Mécanismes de résistance bactérienne aux antibiotiques

Les principaux mécanismes de résistance bactérienne aux antibiotiques sont : l'imperméabilité, la résistance par efflux, la modification de la cible et la modification des antibiotiques(figure 1).

Figure 1: Représentation schématique des mécanismes de résistance aux antibiotiques (Boutaletal.,2017)

1.1 Imperméabilité aux antibiotiques

Bon nombre d'antibiotiques ont des cibles intracellulaires, ce qui implique nécessairement la pénétration à travers la membrane externe et/ou la membrane cytoplasmique pour avoir un effet antimicrobien. La capacité des bactéries à développer des mécanismes pour bloquer la diffusion des antibiotiques à travers leurs membranes est l'imperméabilité. C'est un phénomène très répandu chez les bactéries à Gram négatif pour lesquelles cette diffusion est médiée par des porines notamment pour des antibiotiques comme les tétracyclines, les fluoroquinolones ou les â-lactamines (Pagèset al.,2008). La résistance médiée par les porines peut résulter de plusieurs phénomènes comme le changement de type, de spécificité ou de niveau d'expression de la porine.

1.2 Résistance par efflux

Les pompes à efflux ont pour rôle principall'expulsion des déchets issus du métabolisme bactérien. Elles peuvent également être impliquées dans les phénomènes de résistance aux antibiotiques en limitant l'accumulation de la molécule au contact de sa cible. Une surexpression de ces pompes a un effet délétère sur l'efficacité des antibiotiques (Yasufukuet al.,2011). Ces pompes peuvent être spécifiques d'une ou plusieurs familles d'antibiotiques (Poole K et al., 2005).

1.3 Modification de la cible

Plusieurs phénomènes peuvent être à l'origine de la modification des cibles d'action des antibiotiques avec pour conséquence une perte ou une baisse de l'affinité des antibiotiques pour celles-ci.

o Une modification de la cible suite à une mutation dans le gène correspondant : c'est le cas de la mutation pour les gènes de la gyrase ou de la topoisomérase IV qui confère la résistance aux fluoroquinolones(Hooperet al., 2002) ;

o Une modification enzymatique de la cible: méthylation du ribosome générant une résistance aux macrolides(Leclercq et al., 2002) ;

o Une modification par le remplacement de la cible : acquisition par S. aureus d'une PLP exogène (PLP2a) portée par le gène mecA à l'origine de la résistance à la méticilline. Cette PLP a une faible affinité pour les â-lactamines rendant tous les membres de cette famille inefficace contre Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM) (Hiramatsuet al.,2013);

o Une protection de la cible : l'exemple type est la résistance à la tétracyclineau cours de laquelle la bactérie résistante produit des protéines (TetO et TetM) homologues aux facteurs d'élongation impliqués dans la synthèse protéique. Ces protéines se fixent au ribosome et délogent la tétracycline tout en modifiant la conformation du ribosome empêchant l'antibiotique de se refixer (Donhoferet al.,2012). Une autre protéine qnrconfère également la résistance aux quinolones en agissant comme un homologue de l'ADN qui se fixe sur les sites de liaison à l'ADN de la gyrase et de la topoisomérase IV. Le nombre de complexes ADN/gyrase est ainsi limité ce qui diminue le nombre de complexes gyrase/ADN clivé/quinolone délétère pour la bactérie (Strahilevitzet al.,2009).

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