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Comparaison de trois tests de détection rapide des β-lactamases à spectre elargi dans les échantillons d’hémocultures et d’urines


par Hervé KAFANDO
Université Joseph Ki-Zerbo - DES de biologie clinique 2019
  

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INTRODUCTION/ ENONCE DU PROBLEME

Les bacilles à Gram négatif (BGN) en particulier les entérobactéries sont de loin les germes responsables d'infections du tractus urinaire (ITU) (Sarkiset al.,2017). Dans les bactériémies à BGN les entérobactéries occupent une place prépondérante(Melzeret al.,2007 ; Peraltaet al 2012). Cependant, ces bactéries deviennent de plus en plus une menace mondiale du fait de leur multirésistance aux antibiotiques, essentiellement due à l'acquisition de â-lactamases à spectre élargi (BLSE). L'émergence et la dissémination des BLSE de type CTX-M à l'échelle mondiale en sont la principale cause (Cantónet al.,2016 ;Boutalet al.,2017). Ces enzymes confèrent aux entérobactéries unerésistance à l'ensemble des â-lactamines à l'exceptiondes céphamycines et des carbapénèmes (Netgenet al.,2009).

Longtemps considérée comme un phénomène hospitalier, la résistance par production de BLSE est actuellement en plein essor en milieu communautaire. En effet, le portage communautaire de BLSE est estimé à 70 %, 35 % et 15 % respectivement en Asie, dans l'Est du Bassin Méditerranéen et en Afrique (Woertheret al.,2013). Au Burkina Faso, la prévalence du portage de BLSE était estimée à 22% parmi des volontaires sains et 42% parmi les hospitalisés (Ouedraogoet al., 2017)Les facteurs de risques associés au portage de BLSE sont principalement les conditions d'hygiène précaires et une consommation non négligeable d'antibiotiques de qualité suboptimale (Woertheret al., 2013). Une méta-analyse récente estimait que la prévalence mondiale de BLSE se situait autour de 14 % et augmenterait en moyenne de 5,38 % par an (Karanikaet al.,2016)--.

Les bactériémiesà BLSE sont très souvent associées à un mauvais pronostic comparativement aux mêmes germes sensibles. Ce risque étant essentiellement dû à l'instauration d'antibiothérapie probabiliste inadéquate (Melzeret al.,2007 ; Schwaberet al., 2007).En pratique, les méthodes traditionnelles de diagnostic bactériologique mettent 48 à 72 heures pour l'obtention d'un antibiogramme et 20 à 30% des patients reçoivent une antibiothérapie initiale inadéquate avec une augmentation du taux de mortalité estimé à 7,6% pour chaque heure d'antibiothérapie efficace retardée (Kumar A et al.,2006).

La résistance des entérobactéries aux céphalosporines de troisièmegénération (C3G)qui sont les molécules les plus couramment prescrites, pose unproblème de choix des antibiotiques au coursdes traitements probabilistesdes infections invasives. L'élaboration de techniques de diagnostic rapide s'avère donc indispensable pour guider au mieux le choix des antibiothérapies probabilistes.Plusieurs outils existent actuellement surle marché mais très peu permettent à partir des produits pathologiques d'identifier à la fois le pathogène et les gènes de résistances. L'appareil ePlex® de GenMark propose un panel d'identification de bacilles à Gram négatif qui sont les plus souvent responsables d'ITU et de bactériémies. Il permet en outre, l'identification des gènes les plus couramment impliqués dans les multirésistances (CTX-M, IMP, KPC, OXA, VIM, NDM).

L'objectif de ce travail était d'évaluer les performances diagnostiques d'un test chromogénique, d'un test immunochromatographique et d'un test de biologie moléculaire pour la mise en évidence de la résistance bactérienne.

o PREMIERE PARTIE: REVUE BIBLIOGRAPHIQUE

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"Il faut répondre au mal par la rectitude, au bien par le bien."   Confucius