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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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3. GenreShigella

La shigellose est une infection intestinale invasive aiguë provoquée par des bactéries appartenant au genre Shigella ; elle se manifeste cliniquement par une diarrhée souvent sanglante(World Health Organization, 2008). Elle est endémique dans de nombreux pays en développement et survient également sous forme d'épidémies accompagnées d'une morbidité et d'une mortalité élevées. Parmi les quatre espèces de Shigella, Shigelladysenteriae type 1 (Sd1) est particulièrement importante car elle est à l'origine de la forme la plus grave de la maladie et peut occasionner de vastes épidémies à l'échelle régionale(World Health Organization, 2008). Les principaux obstacles à la lutte contre la shigellose sont la facilité avec laquelle Shigella se transmet de personne à personne et la vitesse d'apparition de la résistance de cette bactérie aux anti-infectieux(World Health Organization, 2008). L'incidence mondiale de la shigellose a été signalée à environ 165 millions de cas, mais la mortalité a considérablement diminué au cours des trois dernières décennies. Les présentes directives sont destinées à aider les autorités(Dekker & Frank, 2015) sanitaires nationales, les responsables de la santé publique et les professionnels de santé, y compris les membres d'agences internationales et d'organisations non gouvernementales (ONG), dans leurs efforts de lutte contre la shigellose endémique et épidémique. Le texte décrit l'épidémiologie, les aspects cliniques et la prise en charge de la maladie ainsi que les mesures à prendre pour se préparer aux épidémies dues à Sd1 et les maîtriser(World Health Organization, 2008). Les définitions suivantes s'appliquent aux termes utilisés dans le présent document :

ü Diarrhée sanglante. Il s'agit d'un diagnostic clinique qui désigne tout épisode de diarrhée dans lequel les selles molles ou aqueuses contiennent du sang frais visible(World Health Organization, 2008). Le terme de diarrhée sanglante ne s'applique pas aux épisodes dans lesquels le sang est présent en traînées à la surface de selles moulées, n'est détecté que par examen microscopique ou au moyen de tests biochimiques ou dans lesquels les selles sont rendues noires par la présence de sang digéré (méléna). Bien que la diarrhée sanglante ait de nombreuses causes, cette définition simple est largement utilisée pour la surveillance de la shigellose dans la communauté.

ü Dysenterie. Ce terme à la même signification que celui de diarrhée sanglante. Bien que les textes médicaux l'utilisent souvent pour désigner un syndrome de diarrhée sanglante avec fièvre, crampes abdominales, douleurs rectales et selles contenant du mucus, ces aspects n'accompagnent pas toujours la diarrhée sanglante ni ne définissent nécessairement son étiologie ou déterminent le traitement approprié(World Health Organization, 2008).

ü Dysenterie bacillaire. Il s'agit d'une dysenterie provoquée par Shigella. Ce terme est souvent utilisé pour distinguer la shigellose de la dysenterie amibienne, qui est due à Entamoeba histolytica(McQuade et al., 2020).

ü Diarrhée invasive. Ce terme désigne la diarrhée due à des bactéries pathogènes, dont Shigella, certaines Salmonelles, Escherichia coli et Campylobacter jejuni, qui envahissent la muqueuse intestinale où elles provoquent inflammation et lésions tissulaires(Rogawski McQuade et al., 2020). Lorsque du sang visible est présent, l'épisode peut aussi être qualifié de dysenterie ou de diarrhée sanglante    (Mahmoudi et al., 2017).

Il s'agit de bactéries adaptées au parasitisme du côlon de l'homme grâce à un plasmide responsable de leur invasivité.Le genre Shigella est responsable de la dysenterie, résultat de la destructiondes cellules épithéliales de la muqueuse intestinale et du rectum. Il produit uneentérotoxine. La transmission de Shigella sppse fait d'Homme à Homme ou par l'intermédiaire d'eau ou aliments contaminés par des déjections humaines. C'est une pathologie endémique dans les pays les moins avancés avec une atteinte préférentielle des enfants de moins de 5 ans (Afssaps, 2010).

Quatre espèces sont observées sur la base antigénique du polysaccharide O pariétal : Shigella dysenterae, Shigella flexneri, Shigella boydiiet Shigella sonnei (Delarras, 2014)

Les Shigelles sont des bactéries strictement humaines. Elles ne font pas partie de la flore intestinale normale ; on ne les trouve que chez les malades, les convalescents et les rares porteurs sains. Elles sont responsables de dysenterie bacillaire (Shigella dysenteriae1) qui décimait les armées en campagne. Actuellement, elles sont la cause, chez l'adulte, de colites infectieuses et chez l'enfant, de gastro-entérites sévères avec diarrhée muco-purulente et sanglante, fièvre et déshydratation. Ces infections surviennent par petites épidémies familiales ou des cantines scolaires. En France, c'est Shigella sonneique l'on isole le plus souvent. Les Shigella sont essentiellement rencontrées dans les pays chauds, en Asie (Shigella flexneri, Shigella boydiiet Shigella sonnei), en Afrique particulièrement au Burkina Faso, au Tchad, au Niger, Mali etc... (Le Minor et Veron, 1989).

Il existe quatre espèces de Shigella : Shigella dysenteriae1, Shigella flexneri, Shigella boydii et Shigella sonnei.

Le bacille de Shiga (Shigella dysenteriae 1) est sans contester celui qui détermine la dysenterie la plus grave. Elle est la cause des grandes et longues endémies de dysenterie. En plus de l'endotoxine sécrétée par l'ensemble des Shigelles, Shigella dysenteriae 1 élabore de plus une toxine protéique qui le rend plus pathogène que les autres. Son pouvoir pathogène expérimental est net pour le lapin(Lavergne et Burdin 1969 ; Pilet et al., 1979). L'injection intraveineuse de 1/10 à 2 ml d'une culture de 24 heures en bouillon au lapin, entraîne après deux à trois jours l'apparition d'une parésie, puis d'une paralysie du train antérieur. Des selles diarrhéiques sont émises, le train postérieur se paralyse. L'animal entre en coma, puis meurt. Ce bacille a pour biotope préféré les pays chauds et particulièrement en Asie. Les autres espèces, Shigella flexneri, Shigella boydii et Shigella sonnei provoquent également des diarrhées, mais dont le pronostic est nettement plus favorable (Dupeyron, 1997 ; CDC, 2002, Lavergne et Burdin, 1969). Il ressort que les principales causes des troubles digestifs sont les bactéries (Escherichia coli, Salmonella et les Shigella) (Bessimbaye et al., 2013).

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