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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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2.11.3. Toxi-infections alimentaires collectives

La consommation simultanée par plusieurs personnes d'un aliment massivement contaminé par des Salmonella « mineures » (Salmonella typhi murium, S. enteritidis, S. dublin, etc...) entraîne une cascade des cas de gastro-entérites, qui, simulant un véritable empoisonnement, est appelé toxi-infection alimentaire collective (TIAC). La période d'incubation est de 10 à 18 heures. Les troubles durent en général 2 à 5 jours. Les complications sont rares sauf chez les sujets à faibles moyens de défense. L'aliment responsable est identifié par enquête épidémiologique (enquête cas-témoin). Le diagnostic se fait par la recherche de Salmonella dans les selles des malades et dans l'aliment incriminé (s'il est encore accessible). Le traitement est le même que celui des gastro-entérites (Avril et al., 1992). La prévention repose essentiellement sur l'hygiène des cuisines collectives (détection des porteurs sains, techniques de préparation, techniques de conservation : « chaîne du chaud » ou « chaîne du froid », etc....).

2.12. Cycle infectieux de Salmonelle

Le cycle infectieux de Salmonella fait intervenir 3 grandes étapes : (i) l'attachement, (ii) l'invasion cellulaire et (iii) la survie et la multiplication intracellulaire.

2.12.1 Attachement aux cellules

La première étape dans la pathogénie de Salmonella est l'attachement à la muqueuse intestinale dans les parties distales de l'intestin (Lockman and Curtiss, 1992). Les protéines, appelées adhésines, sont des molécules de surface bactériennes qui permettent à la bactérie de cibler et de coloniser les tissus de l'hôte par la reconnaissance d'un récepteur spécifique ou non. Il existe 2 grandes familles d'adhésines décrites ci-dessous : les fimbriae ou pili, et les adhésines non fimbriaires. Le LPS et le flagelle, qui jouent aussi un rôle dans l'adhésion des salmonelles, sont ensuite présentés.

2.12.2 Invasion cellulaire

Après avoir adhéré à l'épithélium intestinal, les salmonelles peuvent être transloquées via les cellules M et les phagocytes CD18+, mais elles sont aussi capables d'induire leur propre internalisation à l'intérieur de cellules non phagocytaires professionnelles. Salmonella possède différents facteurs d'invasion. Le mécanisme d'entrée le mieux caractérisé chez Salmonella est un mécanisme de type Trigger, c'est-à-dire qu'un système de sécrétion de type III injecte différents effecteurs bactériens directement à l'intérieur des cellules hôtes. Ces effecteurs vont activer directement différentes protéines cellulaires, amenant à une intense polymérisation d'actine qui va se traduire par la formation de forts renflements membranaires.

2.12.3. Survies et Multiplication Intracellulaire

Dès que Salmonella entre dans la cellule hôte via son T3SS-1, elle se retrouve dans une vacuole d'endocytose appelée la SCV. Bien que les effecteurs SopB, SipA, AvrA et SptP sécrétés par le T3SS-1 soient impliqués lors de la phase précoce de la biogénèse de la SCV, le principal facteur permettant la survie et la multiplication intracellulaire est un deuxième système de sécrétion de type III, appelé T3SS-2 (Ibarra and Steele-Mortimer, 2009). Malgré le rôle crucial du T3SS-2 dans la virulence des salmonelles, le fonctionnement du T3SS-2 et les interactions de ses effecteurs avec les protéines cellulaires sont moins bien connus que ceux du T3SS-1.

Tableau VII : Sérotypes de Salmonella isolés à N'Djamena au Tchad

Sérotypes

Nombre

Source

Origine

S. Dublin 1

1

Hémocultures

Humaine

S. Uganda

1

Coprocultures

Humaine

S. Singapore

1

Coprocultures

Humaine

S. Hull

2

Coprocultures H

umaine

S. Branderup

1

Coprocultures

Humaine

S. Colindale

1

Coprocultures

Humaine

S. Infantis

2

Coprocultures

Humaine

S. Manhattan

1

Coprocultures

Humaine

S. Chagoua

2 C

oprocultures

Humaine

S. Enteritidis

5

Ganglions mesenter.

Bovins

S. Dublin

2

Ganglions mesenter.

Bovins

S. Amager

1

Ganglions mesenter.

Bovins

S. Milezi

1

Ganglions mesenter.

Bovins

S. Tchad

1

Ganglions mesenter.

Bovins

S. Dublin

1

Viscères

Caprins

S. Enteritidis

1

Viscères

Caprins

S. infantis

1

Viscères

Caprins

S. Teshie

1

Viscères

Caprins

S. Gallinarum

26

Cadavres

Poules

S. Hull

2

Cadavres

Poules

S. Anatum

1

Cadavres

Poules

S. Virchow

1

Cadavres

Poules

Source : (Perpezat et al., 1964)

2.13.3 Signes cliniques et traitements

Les salmonelloses d'origine animale provoquent une infection intestinale chez l'homme. Celles-ci sont provoquées par des Salmonella ubiquistes présentes chez l'homme etles animaux et se caractérisent par une période d'incubation de 8 à 48 heures, après l'ingestion d'aliments contaminés et le développement rapide d'une fièvre, de céphalées et de malaises. La durée d'incubation dépend de la dose ingérée, de la santé de l'hôte et des caractéristiques de la souche de Salmonella. Dans la phase d'état, les principaux symptômes sont des douleurs abdominales, des nausées, des vomissements et de la diarrhée. L'évolution clinique est, en général, bénigne et la guérison intervient au bout de 2 à 4 jours. Bien que la salmonellose affecte des sujets de tous âges, la fréquence est beaucoup plus élevée chez les jeunes enfants, les personnes âgées et les malades immunodéprimés chez lesquels l'infection peut être plus sévère, voire mortelle (Weill, 2008). Dans les formes habituelles, la guérison est spontanée en quelques jours et seul un traitement symptomatique est préconisé. Le recours aux antibiotiques est donc à réserver aux patients présentant soit une forme sévère ou des risques de complication. Les fluoroquinolones (FQ) sont considérées comme le traitement de choix chez l'adulte. Chez l'enfant, il fait appel aux céphalosporines de troisième génération (C3G), les FQ étant en général déconseillées pour cette tranche d'âge. Les antibiotiques les plus anciens comme les aminopénicillines, l'association triméthoprime -sulfaméthoxazole (Sxt) et beaucoup plus rarement, les phénicolés, peuvent être utilisés comme solutions alternatives (Weill, 2008).

Ø Prévention

La meilleure protection contre le risque de salmonellose est une bonne cuisson des aliments, en particulier des viandes, à au moins 65°C pendant 15 à 30 minutes. Pour le steak haché congelé ou surgelé, la cuisson doit être effectuée sans décongélation préalable, car elle augmente le risque de multiplication bactérienne. Le froid bloque le développement des bactéries mais ne les tue pas (Fresney et al., 2007).De 1985 à 1997, la prévalence des infections à Salmonella Enteritidisa fortement augmenté en France : elle touche les élevages de volailles et a la particularité d'être présente non seulement à la surface de la coquille de l'oeuf, mais dans le contenu même d'oeufs intacts. Il est pour cette raison conseillé de conserver les oeufs au réfrigérateur, de maintenir au froid les préparations à base d'oeufs sans cuisson (mayonnaise, crèmes, pâtisseries ...) et de les consommer le plus près possible de leur fabrication. De plus, les personnes les plus vulnérables (personnes âgées, malades, nourrissons, femmes enceintes) devraient éviter la consommation d'oeufs crus ou peu cuits. Enfin, il est conseillé de se laver les mains après contact avec un animal vivant (en particulier les reptiles), voire d'éviter les contacts avec les reptiles de compagnie pour toutes les personnes vulnérables (les nourrissons, les femmes enceintes, les personnes immunodéprimées,

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