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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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Chapitre 2. Profil de résistance aux antibiotiques des Salmonella et Shigella isolés

La méthode des disques ou technique de Kirby Bauer en milieu gélosé a été également utilisées pour la réalisation de l'antibiogramme.

2.1 Méthode de diffusion en milieu gélosé

La méthode de test de sensibilité utilisée est celle de la diffusion en gélose MH (méthode des disques ou technique de Kirby Bauer) selon la technique recommandée par le Comité d'Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie (CASFM, 2022). L'épaisseur de la gélose était de 4 mm, ce qui correspond à un volume de 25 ml pour une boite de Pétri (Ø 90 mm). L'antibiogramme a été réalisé à partir d'une souche pure, isolée sur gélose MH ou en culture pure. Cette méthode est basée sur le fait, lorsqu'un antibiotique est déposé sur la surface d'un milieu gélosé en un point donné, il diffuse en établissant un gradient de concentration inversement proportionnelle au diamètre de l'antibiotique. L'inoculum a été suffisamment dilué et comparé avec le standard des turbidités Mc Farland 0,5, qui est la densité optimale de sorte qu'après culture sur milieu de Mueller-Hinton il ait la formation de colonies toutes isolées mais jointives.

Dans les 15 minutes suivantes l'ajustement de la turbidité de la suspension d'inoculum, il a été trempé un écouvillon de coton dans la suspension. L'écouvillon trempé a été pressé fermement en le tournant contre la paroi inférieure du tube juste au-dessus du niveau du liquide pour enlever l'inoculum excédentaire. Ensuite, il a été étalé à trois (3) reprises sur la surface entière de la gélose, en tournant la boite à environ 60 °, après chaque application, pour obtenir une distribution égale de l'inoculum. Enfin partout du bord de la surface de la gélose a été écouvillonné.

2.2 Les disques d'antibiotiques

Tous les disques utilisés ont été fourni par la maison bioMérieux (réf: 55561 ; lot : 102014010). Les antibiotiques utilisés pour l'antibiogrammes proviennent des disques Bio Mérieux, disques Pasteur, Rosco et Difco, Bio Rad et DebenDiangosticsLt. Les antibiotiques sont issus des familles suivantes : Béta-lactamines (Pénicillines et Céphalosporine), Phénicolés, Cyclines, Sulfamides, Polypeptides et Quinolones.

Des disques de papier buvard de 6,35 mm de diamètre imprégnés d'une charge déterminée en antibiotique ont été utilisés pour les tests d'antibiogramme. 5 à 10 min après l'inoculum, les disques d'antibiotiques ont été appliqués sur les boites de Pétri. Les disques ont été placés individuellement avec des pinces stériles ou à l'aide d'un distributeur contre la gélose. Le nombre des disques par boites de Pétri doit être tel que les zones d'inhibition ne se coupent pas afin de permettre la lecture des diamètres dans plusieurs directions. Le nombre des disques choisi varie entre 6 à 7 par boite de 90 millimetres. Une fois que les disques ont été placés sur la gélose, elles sont laissées à la température du laboratoire (25 ° C) pendant environ 30 minutes puis ils sont portés à l'incubation pendant 24 heures à 37 ° C. Après une nuit d'incubation. La mesure du diamètre de chaque zone d'inhibition (diamètre du disque compris) en mm a été faite à l'aide d'un instrument de mesure gradué appelé pied de coulisse ou d'une règle graduée. La technique de disposition de disques d'antibiotiques est représentée par le schéma suivant :

Figure 18 : Technique de disposition des disques d'antibiotiques

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