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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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Chapitre 2.Profil de résistance aux antibiotiques des Salmonella et Shigella isolés

Au cours de notre période d'étude, nous avons observé une augmentation significative de la résistance bactérienne, attribuable à une utilisation inappropriée des antibiotiques. Parmi les 1370 échantillons de selles et de sang analysés, nous avons isolé 50 souches de bactéries, toutes appartenant à la famille des Entérobactéries, avec 30 souches de Shigella et 20 souches de Salmonella. Ces souches ont présenté une résistance élevée de l'ordre de 85% aux antibiotiques de la classe des Bêta-lactamines, notamment l'ampicilline et l'amoxicilline.

2.1 Analyse de l'efficacité des antibiotiques face aux agents bactériens isolés

Le tableau XIII a été utilisé pour évaluer l'efficacité des antibiotiques sur les 50 souches de Salmonella et Shigella isolées dans les quatre hôpitaux de district et au CHU ME. L'étude a porté sur le test de 20 antibiotiques provenant de six familles différentes sur les 50 agents bactériens isolés, comprenant S. Typhi (Salmonella Typhi, 10 cas), S. para Typhi A (Salmonella Para Typhi A, 5 cas), S. para Typhi B (Salmonella Para Typhi B, 5 cas), Shigella Spp(10 cas), Shigella flexneri (6 cas), et S. dysenteriae 1 (Shigella dysenteriae1, 8 cas), ainsi que Shigella sonnei (6 cas). Les proportions de résistance (R) et de sensibilité (S) obtenues sont consignées dans le tableau (Le tableau XIII).

Tableau XIII :Analyse de l'efficacité des antibiotiques face aux agents bactériens isolés

Bactérie isolé

 

Antibiotique utilisé par pourcentage (%)

 

AMP

AMC

CTX

SXT

IMI

CHL

CIP

Am

NA

CI

ATM

OFX

NOR

MA

Shigella Spp

S

21,42

42,14

67,85

39,28

100%

34,14

75

42,85

89,28

21,42

100

100%

10,0

80%

 

R

78,57

57,85

32,14

60,71

0%

67,85

25

57,14

10,71

78,57

0

0%

90,00

20%

Shigella flexneri

S

54,54

34,14

34,14

55,9

70,5

54,54

93,7

18,18

21,42

72,72

93,7

70,5

33,33

93,7%

 

R

45,45

67,85

67,85

44,1

29,5

45,45

6,3

81,81

78,57

27,27

6,3

29,5

66 ,6

6,3%

Shigella dysenteriae 1

S

18,18

18,18

34,14

34,14

80,3

39,28

80,3

70,5

90,9

55,9

75

42,85

100%

90,3%

 

R

81,81

81,81

67,85

67,85

19,7

60,71

19,7

29,5

9,09

44,1

25

57,14

0%

09,7%

Shigella sonnei

S

39,28

54,54

21,42

30

54,54

54,54

70

21,42

63,63

81,5

81,5

75,80

66 ,6

70%

 

R

60,71

45,45

78,57

70

45,45

45,45

30

78,57

36,36

18,5

18,5

14,2

33,33

30%

Salmonella Para Typhi B

S

19,28

34,14

40

45

21,42

18,18

100%

10,18

81,5

55,25

81,5

55,9

60%

100%

 

R

80,71

67,85

60

55

78,57

81,81

0%

89,81

18,5

44,75

18,5

44,1

40%

0%

Salmonella Para TyphiA

S

10,18

63,63

100%

54,54

29,7

18,18

90,9

72,72

100

42,85

75

100%

100%

93,9%

 

R

89,81

36,36

0%

45,45

61,3

81,81

9,09

27,27

0

57,14

25

0%

0%

6,09%

Salmonella Typhi (10)

S

9,1

39,28

100%

55,9

70,5

10,7

93,7

40

94,54

18,18

70,5

55,9

60%

93,7%

 

R

81,9

60,71

0%

44,1

29,5

89,3

6,3

60

05,45

81,81

29,5

44,1

40%

6,3%

Legende :R = Résistance, S = Sensible (NCCLS, 2022), vis-à-vis de chaque antibiotique on a une zone de résistance (R) sensible (S) suivant : Ampicilline (AM):

R<11, S= 17 ; Amoxicilline + acide Clavulanique (AMC) : R< 14, S= 21 ; Oflaxine (OFX) : R< 15, S= 22 ; Ceftriaxone (CTX) : R< 15, S= 21 ; Chloramphénicol (C): R< 19, S= 23 ; Amikacine (Am) : R< 17, S= 19 ; Colistine (Cl) : R< 8, 8 = I= 11, S= 12 ; Triméthoprime Sulfamides (SXT) : R < 10, S = 19 ;Aztreonam (ATM) : R< 15, S= 22 , Acide Nalidixique (NA) : R< 15, S = 20,Imipenem (IMI) R<11, S= , Céfamadole (MA) : R< 15, 15 = I= 21, S= 22 ; 17,Norfloxacine (NOR) : R< 22, 22 = I= 25, S= 25   et Ciprofloxacine (Cip) : R< 15 ( CASFM,2022).

Le tableau XIII indique l'évaluation de l'efficacité des antibiotiques sur les agents bactériens isolés dans notre lieu d'etude. L'étude a concerné le test avec 14 antibiotiques issus de six familles différentes sur 50 agents bactériens isolés Salmonella Typhi (10), Salmonella Para Typhi A (5), Salmonella Para Typhi B (5), Shigella Spp (10), Shigella flexneri (6),Shigelladysenteriae (8), Shigella sonnei (6).

Le profil antimicrobien des espèces isolées de Salmonella et Shigella (N=50) a été évalué pour 14 antibiotiques à l'aide de la méthode de diffusion sur disque, conformément aux recommandations de l'antibiogramme. Les isolats de Salmonella et Shigella ont présenté des niveaux variables de résistance vis-à-vis des antimicrobiens testés.

Environ 37 % des isolats ont montré une sensibilité inférieure aux seuils de résistance standards pour l'ampicilline. La résistance la plus élevée a été observée contre l'ampicilline, avec 87 % des isolats résistants, suivie de la résistance à la Amikacine. En revanche, tous les isolats étaient sensibles à la ciprofloxacine et imipenem.

La résistance globale aux 14 antimicrobiens testés était plus élevée chez les isolats de Salmonella (33 %) par rapport à ceux de Shigella (30 %). L'ampicilline a enregistré le taux de résistance le plus élevé, atteignant 89 % pour les isolats de Salmonella et 80 % pour ceux de Shigella.

À l'opposé, la ciprofloxacine et Aztreonam ont montré la résistance la plus faible, tous les isolats étant sensibles à cet antibiotique. Les isolats de Shigella ont montré un faible taux de résistance à la Céfamadole etAztreonam (20%), tandis que les isolats de Salmonella n'ont présenté aucune résistance à l'acide nalidixique.

Enfin, en ce qui concerne les antibiotiques fréquemment prescrits, tels que le chloramphincole, et Amoxicilline + acide Clavulanique, la résistance était de 67 % pour les isolats de Shigella et de 60 % pour ceux de Salmonella.

D'une manière générale, les souches étudiées présentaient une bonne sensibilité aux Quinolones (Acide nalidixique) et Fluoroquinolones (Ciprofloxacine et Norfloxacine). Par contre 70, 9% des isolats étaient résistants à l'ampicilline et au Chloramphénicol,, 25,3% Aztreonam , 25,8% à laCéfamadole et Amikacine 25,4% . Les salmonella Para Typhi manifesté une grande résistance de l'ordre moyenne de 70% auxBêta-lactamines et aux autres classes des antibiotiques testés excepté le Céfamadole

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