INTRODUCTION GENERALE
La gastro-entérite est une affection au niveau de
l'estomac et des intestins, souvent provoquée par des agents
pathogènes tels que les bactéries, les virus ou les parasites
(McQuade et al., 2020). Dans les pays en développement, les
diarrhées aiguës infectieuses sont à l'origine d'environ un
tiers des décès dus à la déshydratation (Canada,
2017). Elles restent fréquentes dans nos régions, comme en
témoigne la fréquence des toxi-infections alimentaires familiales
ou des collectivités (crèches, etc.) (Mariani-Kurkdjian et al.,
2016). La diarrhée aiguë est définie par l'émission
d'au moins trois selles liquides et/ou molles par jour depuis moins de 14 jours
(Mariani-KurkdJIAN et al., 2016). Les Salmonella et Shigella, deux
espèces de bactéries pathogènes, sont souvent liées
aux épidémies de gastro-entérite à travers le monde
(Rogawski, McQuade et al., 2020). Les infections à parasites
intestinaux, à Salmonella et à Shigella sont
les principaux problèmes de santé publique dans le monde, en
particulier dans les pays en développement, en raison de
l'inaccessibilité de l'eau salubre et des pratiques de manipulation
d'aliments non hygiéniques des préposés à la
manutention des aliments (Mama et al., 2016). Ces micro-organismes peuvent
entraîner des infections graves, voire mortelles, surtout chez les
populations vulnérables telles que les jeunes enfants, les personnes
âgées et les individus immunodéficients (Vu, 2020). Les
enfants de moins de cinq ans sont les plus exposés et environ 125 000
meurent chaque année (Organisation mondiale de la Santé, 2018). .
En effet, on estime à plus de 91 millions le nombre de cas et à
137 000 celui des décès par an (Organisation mondiale de la
Santé, 2018).
L'épidémiologie des infections à
Salmonella et Shigella est complexe, impliquant divers facteurs tels
que la contamination alimentaire, l'eau contaminée et le contact
interhumain. Parmi les contraintes sanitaires de l'eau, figurent les
bactéries qui sont en général ubiquistes et causent des
maladies dites hydriques telles que la diarrhée, la fièvre
typhoïde, le choléra (Yesigat et al., 2020). Les eaux de forage
sont souvent exposées à de nombreuses contaminations, elles
peuvent donc présenter un risque pour la santé des consommateurs
(Sawadogo et al., 2023).Comprendre la dynamique de transmission de ces agents
pathogènes est crucial pour mettre en oeuvre des stratégies de
prévention et de contrôle efficaces. La gravité des
infections aux agents bactériens, associées aux
conséquences économiques et en santé publique, a
entraîné le développement de nombreuses méthodes
phénotypiques, puis plus récemment, moléculaires pour la
caractérisation des Salmonelles et Shigelles (Grattard
et Pozzetto, 1999). Cette caractérisation s'appuie en premier lieu sur
la détermination du sérotype, méthode très
couramment employée, permettant de suivre les tendances
évolutives dans différentes filières en vue de
l'épidémiosurveillance des Salmonelles et Shigelles
(Laurent &Moez, 2023). Au Danemark, les coûts économiques
liés aux salmonelloses sont estimés entre 10,4 et 25,5 millions
de dollars US en 200 (René et al., 2011).
A ce problème majeur, s'incarnait au cours de ces
dernières décennies, le phénomène de
résistance aux antibiotiques est devenu assez fréquent dans le
genre Salmonella et Shigella (Li et al., 2024). En effet, plusieurs
études ont montré que les Escherichia
colientéropathogènes, Salmonella enterica, Shigella spp,
Yersinia, Campylobacter et Vibrio cholerae sont de plus en plus
résistants aux â-lactamines (ZEBA et al., 2007, HAUKKA,2007). On
assiste également à l'apparition de phénomènes de
résistance inexpliqués (forte prévalence de
bactéries productrices de BLSE chez des enfants dont l'âge
était compris entre 0-12 mois à l'origine de l'impasse
thérapeutique (Dembélé et al., 2015) Au Tchad, les
premières études sur Salmonella datent des travaux de
Perpezat et al., (1964), de Le Minor et al., (1969) et de Guard et al., (1973)
et ont permis de démontrer l'importance épidémiologique
des salmonelloses humaines et animales, ainsi que la diversité des
sérotypes rencontrés.
Au Tchad, la situation sanitaire demeure très
précaire, imputable au contexte socio-économique et au
fonctionnement du système de santé (INSEED, 2014) ;(MSPP,
2022).
Les maladies diarrhéiques demeurent l'une des
principales causes de mortalité et de morbidité chez les enfants
de moins de 5 ans (BESSIMBAYE et al., 2013). De ce fait, elles constituent un
problème majeur de santé publique (MSPP, 2022). L'utilisation
sélective des antibiotiques a touché environ 19 000 personnes
dont 15 900 enfants de moins de 5 ans, chaque année, atteints de
diarrhée (BESSIMBAYE et al., 2013).
Les hôpitaux tchadiens à l'instar des
hôpitaux africains ne sont pas du tout épargnés par les
phénomènes des infections croisés (Bessimbayeet al., 2021)
; (Hassan et al ;2021) ; (Ouchar al., 2019).
Le Tchad ne dispose d'aucun mécanisme de
régulation et de contrôle de l'utilisation des antibiotiques tant
dans le domaine vétérinaire qu'en santé humaine (Tabo,
2013). Les antibiotiques de toutes catégories se vendent à tous
les coins des rues des grandes villes du Tchad, sans aucun contrôle et
dans des très mauvaises conditions de conservation (Tabo,2013).
La caractérisation moléculaire des souches de
Salmonella et Shigella revêt une importance
particulière pour plusieurs raisons. Elle permet de mieux comprendre la
diversité génétique au sein de ces espèces,
d'identifier les souches émergentes, et de tracer l'origine des
épidémies. De plus, la caractérisation moléculaire
peut aider à évaluer la résistance aux antimicrobiens, ce
qui est essentiel pour orienter les choix thérapeutiques et mettre en
place des mesures de lutte contre la résistance aux médicaments.
Ces techniques, en général plus longues et fastidieuses à
mettre en oeuvre, sont plutôt réservées aux enquêtes
épidémiologiques dans un écosystème donné ou
lors d'investigation suite à une toxi-infection alimentaire ou à
une épidémie de salmonellose et de shigellose
(Ung et al. , 2019).
L'étude pourrait donc se concentrer sur la collecte de
données épidémiologiques à partir de cas de
gastroentérite provoquée par Salmonella et Shigella , en
utilisant des méthodes de surveillance sur le terrain. En
parallèle, elle pourrait mettre en oeuvre des techniques de biologie
moléculaire pour caractériser les souches isolées, en
analysant leur génome, en identifiant les gènes de virulence, en
évaluant leurs sensibilités aux antibiotiques et en
étudiant la diversité au sein des micro-organismes pour l'
obtention de l'empreinte génétique entre les différentes
souches étudiées.
Très peu d'études ont été
menées sur ces deux (2) germes ( Salmonella et Shigella ) au
Tchad,, en dehors de la contribution de Tabo et al., (2013) sur l'état
de l'antibiorésistance des souches de Salmonella chez les
humains et les poules pondeuses dans la ville de N'Djamena.
Les résultats de cette recherche contribueraient
à améliorer la compréhension de
l'épidémiologie de la gastro-entérite liée à
Salmonella et Shigella, tout en fournissant des informations
précieuses pour la prévention, la surveillance et le
contrôle de ces infections.
OBJECTIF
Objectif général
Contribuer à une meilleure prise en charge des garstro
entértes causées par les souches de Salmonella et
Shifellaau Tchad.
En Objectif Spécifique ; il s'agit
de :
· Determiner la prevalence des Salmonella et
Shigellaimpliqué dans les gastroenterite
· Déterminer le profil de resistance aux
antibiotiques des Salmonella et Shigella isolés,
· Rassembler les facteurs de risques associés
à la transmission,
· Effectuer la caractérisation moléculaire
des agents bactériens Salmonella et Shigella.
1erePARTIE
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