RESUME
CARACTERISATION DE LA POPULATION DES
DROMADAIRES
(Camelus dromedarius) EN TUNISIE
Les conditions éco-climatiques
(irrégularité de pluviométrie, températures
élevées, vents continuels, etc.) freinent naturellement le
développement de l'élevage dans le Sud tunisien.
Néanmoins, il existe des sites géomorphologiques offrant des
conditions plus ou moins favorables à l'existence des parcours
spontanés caractéristiques (Dhahar, El-Ouara, Djeffara,
etc.). En Tunisie, ces parcours représentent principalement la
seule source alimentaire disponible pour les dromadaires. L'objectif de la
thèse est de décrire les conditions d'élevage des
dromadaires, analyser leur diversité génétique et de
mettre en évidence les perspectives d'exploitation et de valorisation de
leurs produits dans des systèmes d'élevage durables. Sachant que,
le dromadaire occupe une place capitale dans le développement
socioéconomique des éleveurs en raison des multiples biens et
services qu'il procure. Cependant, des pressions d'origines diverses dont la
croissance démographique, les sécheresses
répétitives et des pratiques séculaires, faisant peser
lourdes menaces sur le développement de l'espèce. C'est dans ce
contexte que la présente étude sur la caractérisation de
l'élevage et la diversité génétique a
été entreprise en vue de déterminer les pratiques
régissant la gestion de l'espèce et l'organisation de sa
structure génétique. La connaissance de ces informations est
capitale pour l'élaboration de toute stratégie d'exploitation et
de conservation durable, rentable et bien ciblée. L'analyse de certaines
pratiques d'élevage, a mis en relief des indices montrant que l'aspect
traditionnel demeure dominant. Par ailleurs, nous avons observé qu'il y
avait une tendance peut être timide et silencieuse vers
l'amélioration de la conduite et de la productivité. Le
dromadaire recèle d'importants "gisements" de production actuellement
sousexploités. La mise en oeuvre des techniques d'élevage et des
mécanismes économiques adéquats permettront la mise en
valeur des produits camelins. Pour mieux valoriser, la levée des
majeures contraintes identifiées peut se faire en agissant soit sur
l'animal, soit sur son environnement (parcours, marchés, etc.) ou soit
sur les deux (l'animal et l'environnement) ce qui est l'idéal.
L'étude de la diversité génétique au moyen de 8
loci microsatellites a permis de détecter 34 allèles dans la
population totale et de déterminer la diversité intra et inter
populations, la structure et les distances génétiques entre les
populations étudiées (Kebili, Médenine et Tataouine). Nous
avons trouvé des valeurs relativement élevées pour les
paramètres de diversité intra population avec un
nombre moyen d'allèles par locus (A) de 4,25, un
pourcentage de polymorphisme (P) de 100% et un taux
d'hétérozygotie attendue non biaisée
(Hnb) de 0,61. La matrice des distances
génétiques montre des valeurs peu élevées (0,104 et
0,29) entre les populations prises deux à deux ce qui indique que les
trois populations présentent une ressemblance génétique et
laisse supposer qu'elles appartiennent au même groupe
génétique. La valeur FIT=0,15 indique un
coefficient de consanguinité de 15%. L'importance du flux de
gènes entre les paires des populations et la différentiation
génétique modérée moyenne entre les populations
(FST=0,083) indiquent qu'un niveau d'échange de
gènes assez significatif se fait entre les populations et qu'une part
relativement très importante (92%) de la diversité
génétique totale de l'espèce est d'origine intra
population. Ce niveau de diversité et cette structuration
génétique pourraient être essentiellement le fait de
l'histoire évolutive de l'espèce et surtout les
conséquences des stratégies de reproduction adoptées par
les éleveurs favorisant la consanguinité. Afin de permettre une
bonne conservation des ressources camelines, les résultats de cette
thèse offrent de nouvelles perspectives pour la conservation de
l'espèce. Les résultats informent sur les caractéristiques
de la population cameline, capitales pour le maintien ou capture du maximum de
diversité génétique de l'espèce. La conservation et
la valorisation par l'utilisation durable des dromadaires font appel à
une collaboration renforcée entre les différents intervenants
(profession, développement et recherche scientifique). Cette vision
devrait se formuler en quatre volets : 1) Organisation du secteur, 2)
Protection de l'espèce et ça concerne essentiellement des mesures
institutionnelles (incitations, législations, politiques
économiques à entreprendre, etc.), 3) Valorisation par
l'utilisation des produits et 4) Recherche scientifique afin de répondre
aux questions posées. En somme, espérons que ces résultats
amélioreront et guideront des programmes de conservation et de
développement de l'espèce cameline en Tunisie.
Mots clés :
Dromadaire, pratiques d'élevage, diversité
génétique, marqueurs microsateiites, conservation,
développement, Tunisie.
TABLE DES MATIERES
INTRODUCTION GENERALE 22 CHAPITRE I :
IDENTITE DES CAMELIDES
1- Place des camélidés dans le
règne animal .25
1.1- Systématique 25
1.2- Taxonomie de camélidés 25
2- Origine des camélidés 27
3- Domestication des camélidés .
28
4- Répartition géographique des
dromadaires 29 4.1- Distribution dans le monde 29
4.2-
Distribution en Afrique 30 4.3- Densité des dromadaires 31
4.3.1- Densité très faible .. 31
4.3.2- Densité faible . 31
4.3.3- Densité moyenne 31
4.3.4- Densité
forte 31
5- Milieu naturel du dromadaire .. 32
6- Morphologie générale du dromadaire
. 32
7- Une physiologie générale
orientée vers l'adaptation .. 33
7.1- Adaptation à la chaleur . 33
7.2- Adaptation à la sous-alimentation 34
7.3-
Physiologie de la reproduction .. 35
CHAPITRE II : IMPORTANCE DE L'ELEVAGE CAMELIN ET
SYSTEMES DE
PRODUCTION
1- Introduction 36
2- Importance socio-économique du dromadaire
36
3- Importance écologique du dromadaire
37
4- Modes et systèmes d'élevage .
39
4.1- Systèmes migratoires 40
4.1.1- Nomadisme 41
4.1.2- Transhumance 41
4.2- Systèmes sédentaires 42 5-
Performances des troupeaux 43 5.1- Performances reproductives 43
5.2- Performances laitières 45 5.3- Croissance et production de viande
46 5.4- Performance sportive 48
CHAPITRE III : RESSOURCES GENETIQUES ANIMALES
Introduction 49
Situation mondiale de la biodiversité animale
50
Rôles de la biodiversité animale
52 3.1- Fonctions économique et alimentaire 52 3.2- Fonctions
environnementales 53 3.3- Fonction socioculturelle 54
Conservation de la biodiversité animale
55
Elevage : une biodiversité à gérer
et une richesse à valoriser 56 5.1- Population ovine 57
5.2- Population caprine 57 5.3- Population bovine 57 5.4- Population
cameline 58
Notion de race en élevage 58
Sélection chez le dromadaire 60
Etat des ressources génétiques camelines
dans le monde 61
8.1- Types de grande taille 61 8.2- Types de
taille moyenne 62 8.3- Types de petite taille 62
Etat des ressources génétiques camelines en
Tunisie . 62
Classification des dromadaires selon vocation
64
10.1- Dromadaires à vocation viande 64
10.2- Dromadaire à vocation lait 65
10.3- Dromadaire à vocation mixte 66
10.4- Dromadaire de course 66
CHAPITRE IV : BIOTECHNOLOGIE ET CARACTERISATION
DES
RESSOURCES GENETIQUES ANIMALES
Introduction . 67
Révolution de la génétique
moléculaire 68
Techniques moléculaires 69
3.1-
Historique de l'ADN 69
3.2- Purification de l'ADN 70
3.3- Electrophorèse 72
3.4- Amplification en Chaîne par Polymérase (PCR)
72
3.5- Séquençage 74
Marqueurs génétiques 74
4.1- Marqueurs biochimiques 76
4.2- Polymorphisme de Longueur des Fragments de Restriction
(RFLP) 76
4.3- Amplification Aléatoire d'ADN Polymorphe (RAPD)
76
4.4- Polymorphisme de Longueur des Fragments Amplifiés (AFLP)
77
4.5- Minisatellites 78
4.6- Microsatellites 78
4.7- Polymorphisme de simple nucléotide (SNP) 80
CHAPITRE V : CARACTERISATION DE L'ELEVAGE CAMELIN EN TUNISIE
I- INTRODUCTION 82
II- MATERIEL ET METHODES 83
Présentation et choix des zones de l'étude
83
Collecte des données 85
Traitement des données 86
III- RESULTATS ET DISCUSSION 86 1-
Caractéristiques générales de l'élevage camelin
86 1.1- Taille du troupeau 86 1.2- Gardiennage du troupeau 88
1.3- Conduite et gestion des troupeaux camelins . 88
1.4- Sources des revenus des éleveurs 89
Description des ressources camelines exploitées
.. 90
2.1- Couleur de la robe 91
2.1.2- Safra 91
2.1.3- Chegra 92
2.1.4- Hajla . 92
2.1.5- Beydha 92
2.1.6- Zarga 92 2.2- Dénomination
sociogéographique 93 2.2.1- Rameau de Nefzawa 93 2.2.1.1- Merzouguia
.. 93 2.2.1.2- G'oudia 94 2.2.1.3- Mehari ou Targui 94 2.2.2- Rameau de
l'Aaradh 95
2.2.2.1- Maghrebi 95
2.2.2.2- Khaouar 95
Systèmes et pratiques d'élevage camelin
. 97
3.1- Systèmes d'élevage camelin dans le Sud
tunisien 97
3.1.1- Système pastoral transhumant extensif . 97
3.1.2- Système intensif temporaire : l'embouche . 98
3.2- Pratiques d'élevage camelin 100 3.2.1- Association
élevage - agriculture 101 3.2.2- Alimentation 102 3.2.3- Pratiques
vétérinaires 103
3.2.4- Reproduction et sevrage 104
3.2.5- Production laitière . 105
3.2.6- Sélection de reproducteurs . 105
3.2.6.1- Indicateurs de résistance et tolérance
106
3.2.6.2- Indicateurs d'une bonne laitière 106
3.2.7- Reforme et renouvellement ..... 107
Potentialités des productions . 108
4.1- Production laitière .. 108
4.2- Production de viande . 109
4.2.1- Age et saison de vente des chamelons 109 4.2.2-
Marchés et commercialisation des chamelons . 110 4.3- Autres
productions 111 4.3.1- Production lainière 111
4.3.2- Excréments 112
5- Contraintes de l'élevage camelin en Tunisie
112
5.1- Contraintes socio-économiques . 113
5.1.1- Infrastructures . 113
5.1.2- Services 113
5.2- Contraintes zootechniques 114
5.2.1- Parasitoses et maladies .....114
5.2.2- Alimentation 114
5.2.3- Matériel
génétique 115
VI- CONCLUSION 115
CHAPITRE VI : ANALYSE DE LA DIVERSITE GENETIQUE CAMELINE
EN
TUNISIE
INTRODUCTION 117
MATERIEL ET METHODES 118
Stratégie d'échantillonnage
118
Prélèvement du sang 118
Extraction et évaluation de la qualité et
la quantité de l'ADN génomique 119
Dilution de l'ADN 120
Optimisation de la réaction PCR . 120
Loci microsatellites étudiés ....
122
Electrophorèse sur gel de polyacrylamide
123
Méthodes statistiques et analyses
moléculaires 124
Loi d'Equilibre de Hardy Weinberg . 125
Paramètres de la diversité
génétique 126 10.1- Diversité intra population
126 10.1.1- Nombre moyen d'allèles par locus (A) . 126
10.1.2- Taux
de polymorphisme (P) 126 10.1.3- Taux d'hétérozygote
observé (HO) 127
10.1.4- Taux d'hétérozygote attendu (HE) 127
10.1.5- Indice de Fixation FIS 128
10.2- Diversité génétique inter populations
128
10.2.1- Distance génétique . 129
10.2.2- F statistiques ou F de Wright .....129
10.2.3- Flux des gènes 131
III- RESULTATS ET DISCUSSION 132
Extraction, quantité et qualité de l'ADN
132
Diversité génétique 132
2.1- Diversité génétique intra population
132
2.1.1- Fréquences alléliques . 132
2.1.2 - Richesse allélique 133
2.1.3- Taux de loci polymorphe 133
2.1.4- Hétérozygotie 136
2.1.5- Indice de fixation FIS 136
2.2- Diversité génétique inter population
137
2.2.1- Indice de fixation ou F statistiques 137
2.2.2 - Distance génétique et construction des
dendrogrammes 138
2.2.3- Flux des gènes
140
VI-CONCLUSION 142
CHAPITRE VII : CONSERVATION DES DROMADAIRES EN TUNISIE
I-INTRODUCTION 143 II- EBAUCHE D'UN
SCHEMA DE DEVELOPPEMEMENT ET DE CONSERVATION 144
Organisation du secteur camelin .
.....145
1.1- Registres de données 146
1.2- Associations des éleveurs 147
1.3- Organisation en réseaux 147
Protection de l'espèce cameline . 148
Valorisation des produits camelins 149
Recherche scientifique 149
III- AMELIORATION GENETIQUE 150
VI- CONCLUSION 152
CONCLUSION
GENERALE ET PERSPECTIVES 153
REFRENCES BIBLIOGRAPHIQUES 156
ANNEXES 169
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