Développement d'un modèle d'évolution de gènes.

CHAPITRE 5. ÉTUDE DE CAS

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EN5F 9668$321977 ENSFVG4UCW rZU r3 ENSP6E069323329 EN5PMEMA13961 FNSMJSFIE3E0I37i87 ENSPUd5I1d55I7 ENSPO6659A161Z6 ENSMJSPOINEBUDA720 ENSMJSPOME4130O32 ENSETAF60005.196'51 EN5F 96690345243 EN5P! !EW1Z3a1 ENSMUSNO0E0505592 ENSETPF900E6304195 ENSIIR8Ad354A, kriSPOEUUDA15ZEU ENSP46$50A7323.S EN5B7APOIMEi 6424 ENSEARMIE+3E4a.54Z3 ENSBTANO.5 0522603 EN51115P500 6113245 FN5RTPPAEt7F.0013174F1 ENSLAAF'9d9E412aà12 EN5P26699073245 EN5MJ5PR M1399$1 ENSR1AP!Eb64I238a EN56ARP600E01196615 EN5MLP999E6823556

44

FIGURE 5.1 -- Arbre de gènes de la famille MAG obtenu avec notre méthode

45

CHAPITRE 5. ÉTUDE DE CAS

4 -ENSDARP00000126612

· ENSTRUPO0000006444

- ENSBTAP00000011656

·

--
·E N S BTA P00000049B61

GEN SP00000401502

.' ENSP00000262262

~
·E N S BTAP00000055070

· ENSMUSP00000113245 -ENSMUSP00000058875 .#
·ENSMUSP00000004728

· EN SBTAP00000031748

/
·ENSMUSP00000032667
_.--ENSPOO000413861

· ENSP00000323328

· ENSP00000291707 \
·EN5P00000321077

· ENSBTAP00000022603

· ENSP00000354090

EN SP00000470259 ¹ENSP00000455510

o
·E N S B TAP0000002 6431

· -ENSBTAPODO00055422

· ENSBTAP00000026429

JENSP00000345243 _s ENSP00000412361

· ENSMUSP00000005592 ENSBTAPOO000004195

· ENSDARP00000136924 ^o
·ENSTR UP00000023555

⁴ SP00000376048

.
·E N SBTAP00000052 366

· ENSMUSP00000139564

FIGURE 5.2 -- Arbre de gène de la famille MAG obtenu de Ensembl

CHAPITRE 5. ÉTUDE DE CAS

5.2 Étude de cas de la famille FAM86

Le second cas d'étude concerne la famille FAM86. Les gènes de cette famille subissent également l'épissage alternatif. Il s'agit ainsi d'un bon candidat pour notre étude. Le tableau 5.2 récapitule les informations sur cette famille FAM86.

	Nom de la famille	Source de données	Nombre de gènes	Nombre de protéines
3	FAM86	Ensembl	8	16

TABLE 5.2 - Données utilisées pour l'étude de cas de la famille FAM86

La figure 5.3 présente l'arbre de référence (arbre de gènes) sur lequel viendront se greffer les arbres provenant des groupes restant. L'arbre de gène obtenu comporte 0 pertes de gènes et 3 duplications contre 3 pertes et 4 duplications Notre arbre de gène partage 6 protéines sur 8 avec celui de Ensembl et a un plus petit coût de réconciliation.

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FIGURE 5.3 - Arbre de gène de la famille FAM86 obtenu de notre modèle

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