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Caractérisation génomique des bactériophages isolés en Côte d’Ivoire.


par Aboubacar SYLLA
Université Felix HOUPHOUET- BOIGNY - Master 2 biotechnologies-biosécurité 2017
  

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Conclusion et Perspectives

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Conclusion et Perspectives

Ce travail a permis de caractériser 5 phages à savoir ö Ebrios, ö A5a, ö M3, ö M7, ö M11 par la digestion enzymatique et l'électrophorèse en champ pulsé, de produire des élements de connaissance sur le type de matériel génétque de ses phages ainsi que la taille du génome par des profils de restriction. L'analyse de ses profils obtenus a permis de mettre en evidence des différences entre les phages. Cela a permis de démontrer la diversité génétique entre les phages étudiés.

Il en résort que le PFGE s'est avéré être une méthode plus sensible que la digestion enzymatique pour la caractérisation des phages au vue des résultats rapportés. Il a révelé plus de bandes discriminantes que la digestion enzymatique. Le PFGE et la digestion enzymatique sont deux méthodes dépendantes. La digestion enzymatique des phages est simple et rapide et pourrait être excellente dans la mise en oeuvre en première intention de la discrimination des contraintes.

En définitive, les profils de restriction du PFGE et de la digestion enzymatique permettent de comparer plusieurs échantillons ; cependant, ils ne donnent malheureusement pas accès à l'information génétique en tant que telle.

En perspectives, il serait intéressant de poursuivre ce travail de recherche afin de réaliser l'étude des gènes d'intéret par PCR suivie de séquençage à haut débit (NGS) afin de fournir de précieuses informations sur la diversité de ces gènes.

Ce type d'information pourra à long terme permettre de réaliser la métagénomique afin d'avoir une meilleure compréhension sur la diversité génétique ainsi que la composition de ses phages.

Le monde étant actuellement confronté aux infections nosocomiales difficiles à traiter, les bactériophages représentent une alternative intéressante et un potentiel médicinal naturel offrant une panoplie d'applications relativement peu coûteuses, permettant de répondre en toute sécurité à la lutte antibactérienne.

Il serait important de caractériser des phages comme candidats potentiels à la phagothérapie.

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