6.3.4 L'analyse AMMI
Les résultats de l'analyse AMMI montrent la
signification des deux premières composantes de l'interaction (IPCA),
qui sont utilisées pour construire le biplot AMMI2. Les deux composantes
expliquent 92.65% de la somme des carrés des écarts de
l'interaction G x L (76.01% pour le IPCA1 et 16.64% pour le IPCA2). La
résiduelle du modèle AMMI2 n'est statistiquement pas
significative (Tableau 6.12). Comparativement aux 10.13% de l'interaction G x L
non significatifs, indiqués par le modèle de l'analyse de la
régression conjointe, le modèle AMMI apparaît plus
efficace, vu qu'il arrive à expliquer une importante proportion de
l'interaction G x L (Tableau 6.12).
Le biplot AMMI1, est une représentation graphique de
l'effet principal génotype, l'effet localité et de l'interaction
G x L expliquée par la première composante principale IPCA1 du
rendement en grains. Le graphe explique 98.52% de la somme des carrés
des écarts des traitements, qui se répartissent entre 91.78,
somme des carrés des écarts des localités ; 2.06, somme
des carrés des écarts des génotypes et 4.67%, pour la
somme des carrés des écarts de l'interaction G x L (Figure 6.11,
Tableau 6.12). La somme des carrés des écarts de la
première composante IPCA1, qui représente 76.01% de la somme des
carrés des écarts de l'interaction G x L, est plus
élevée en valeur que la somme des carrés des écarts
génotype, suggérant l'importance de tenir compte de l'interaction
dans l'estimation des effets génotypes évalués dans
différentes localités.
Selon GAUCH et ZOBEL, (1996) [166] dans des essais multi site,
on trouve souvent que la variation due à l'interaction est plus
importante que celle due à l'effet génotype. Le score d'un
génotype sur de la première composante IPCA1, sur le plan
représenté par le biplot AMMI1 est un indicateur de la
stabilité des performances de ce génotype dans les
différentes localités. Plus élevée est la valeur,
négative ou positive, du score, plus le génotype en question
montre une adaptation spécifique à un site ou de groupe de sites
donnés. Un score de l'IPCA proche de zéro (près de
l'origine) est indicateur d'une faible interaction et donc d'une
stabilité élevée [13].
104
Les génotypes Bichena/Ariza_2//Solga_8 (n°3),
Rascom/Sla_3/3/Plata_1/ Snm// Plata_9 (n°8), Boussellem/Ofonto//waha
(n°27) et FI 02 (n°24) présentent un faible score sur l'IPCA1;
ils contribuent, donc, relativement moins à l'interaction G x L. Ils
sont considérés comme des variétés à large
adaptation pour l'ensemble des sites d'évaluations. Ces génotypes
diffèrent cependant du point de vu effet principal du rendement en
grains (Figure 6.11).
Les génotypes Bichena / Ariza_2//Solga_8 (n°3) et
Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff / Fg /3/ Mtl-5 (n°12) comme les génotypes
Sula /RBCE_2/3/Hui //CIT 71/Cii/4/Ryps27_3/... (n°7), D68-1-93A-1A//Ruff
/Fg /3/ Mtl-5/4/Lahn (n°13), Gta/Dur... (n°15) et
Rascon/Sla_3/3/Plata_1/Snm//Plata_9 (n°8) ont le même effet
principal mais diffèrent pour la contribution à l'interaction.
Par contre les génotypes Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff / Fg /3/ Mtl-5
(n°12), Gta/Dur... (n°15), Mck_2/Aco89 (n°2), Silver_26 /
Toska_26 (n°4), Waha (n°5), Boussellem (n°20), FI 05
(n°23), Kucük (n°17) et Ofonto/Waha//MBB (n°28)
diffèrent pour l'effet principal et l'interaction (Figure 6.11).
Vu leurs scores sur l'IPCA1, toutes les localités se
caractérisent par une interaction G x L élevée. KH et ST
se regroupent dans le quadrant inférieur, montrant un effet principal
élevé et partageant les mêmes meilleurs génotypes
(winners). De ce fait ces sites représentent un même domaine de
recommandations (Figure 6.11). Le site OS s'oppose aux sites KH et ST; il
classe différemment les génotypes comparativement aux autres
sites. OS montre une performance de rendement moyenne alors que le site de TR
présente la plus faible performance de rendement en grains (Figure
6.11).
Une relation de type linéaire apparaît entre les
scores sur l'IPCA1 et l'effet moyen du biplot AMMI1, suggérant que les
génotypes qui se caractérisent par des effets principaux
extrêmes : Les génotypes Sula /RBCE_2/3/Hui //CIT
71/Cii/4/Ryps27_3/... (n°7), Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff / Fg /3/ Mtl-5
(n°12) et D68-1-93A-1A//Ruff /Fg /3/ Mtl-5/4/Lahn (n°13) avec
Aram-5/Cali//Rascon-37/3/Plata-8 (n°22), MBB/Ofonto//Radiosso/Waha
(n°30), et Inter_9/Poho_1 (n°16) présentent des scores de
l'interaction G x L opposés. Le premier groupe présente
Au contraire, les génotypes Waha (n°5), Srn_3 /
Nigris_4 // Porto_5 (n°11), Plata_1/Snm // Plata_9/3/Green (n°14),
Inter_9/Poho_1 (n° 16), Kucük (n°17),
105
des scores positifs et le second groupe présente des
scores négatifs et par conséquence ces deux groupes de
génotypes sont adaptés à différents milieux.
-0.500
-1.000
2.000
0.500
0.000
1.500
1.000
0.00 1.00 2.00 3.00 Grain yield (t/ha) 4.00 5.00
6.00
TR
OS
28
17
23 20
24
26
22
16
21
1
29 25
30
9
14
5
7
8
15
13 12
27
Y.. =3.64
3
ST
KH
Figure 6.11 : Biplot AMMI1 des effets principaux
génotypes et sites et de l'interaction de la première composante
IPCA1 du rendement en grains.
Analysant ensemble les scores de l'interaction et les effets
principaux,
les génotypes : Minimus/ Rascon_19 (n°1),
Mck_2/Aco89 (n°2),
Bichena / Ariza_2//Solga_8 (n°3), Silver_26 /
Toska_26 (n°4), Minimus_7// Auk /Oste /3/ Shag_26 (n°6), Sula
/RBCE_2/3/Hui //CIT 71/Cii/4/Ryps27_3/... (n°7),
Rascon/Sla_3/3/Plata_1/Snm//Plata_9 (n°8), Sn Turk Mi 83-84 375/Nigris_5//
Tantl_1/3/... (n°9), Hoggar (n°10), Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff / Fg /3/
Mtl-5 (n° 12), D68-1-93A-1A//Ruff /Fg /3/ Mtl-5/4/Lahn (n°13),
Gta/Dur... (n°15), et D68-1-93A-1A //Ruff/Fg/3/Mtl-5/4/Lahn (n°21)
ont des scores IPCA1 positifs comme celui du site OS. Ces génotypes
montrent donc une adaptation spécifique à ce site.
106
Aaz 77_2/Porron_11//Busca_3 (n°18), Altar84 (n°19),
Boussallem (n°20), Aram-5/Cali//Rascon-37/3/Plata-8 (n°22), FI 05
(n°23), FI 02 (n°24), Cirta (n°25), Ting7/2*Green-3 (n°26),
Boussellem/Ofonto//waha (n°27), Ofonto/Waha//MBB (n°28), Tr
32225/Gediz//Ofonto (n°29) et MBB/Ofonto//Radiosso/Waha (n°30)
montrent une adaptation aux sites KH, ST et TR qui se distinguent par des
scores IPCA1 négatifs (Figure 6.11).
Le génotype Bichena / Ariza_2//Solga_8 (n°3) se
distingue par un haut rendement grain et une bonne stabilité, il
présente une large adaptation à trous les sites
d'évaluation. Par contre les génotypes Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff /
Fg /3/ Mtl-5 (n°12), D68-1-93A-1A//Ruff /Fg /3/ Mtl-5/4/Lahn (n°13)
et Sula/Rbce2/3/Hui//Cit71/CII/4/ Ryps27_3/... (n°7) montrent une
adaptation spécifique au site OS (Figure 6.11). Aucun génotype
à haut rendement ne montre une adaptation spécifique aux sites
KH, ST et TR (Figure 6.11).
Ces résultats indiquent que le sélectionneur a
le choix entre la sélection du génotype Bichena /
Ariza_2//Solga_8 (n°3) qui montre une adaptation générale en
plus de son potentiel de rendement élevé, pour tous les sites ou
bien recommander ce génotype aux régions
représentées par les sites KH, ST et TR et de sélectionner
le génotype Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff / Fg /3/ Mtl-5 (n°12)
spécialement pour la région représentée par le site
OS.
Le gain de rendement attendu est estimé selon la
méthode décrite par ZOBEL et al., (1988) [13] à
partir de l'effet principal génotype + l'effet principal site - la
moyenne générale de l'ensemble des sites + le produit des scores
IPCA1 du génotype x celui du site. L'adoption du génotype Bichena
/ Ariza_2//Solga_8 (n°3) pour toutes les localités donne un gain de
rendement de 0.74 t/ha = (4.38 -3.64), par contre le gain de rendement produit
par l'alternative est égale à 1.0 t/ha = (4.64-3.64).
La stratégie associant l'adaptation
générale à une large région
représentée par les trois sites KH, ST et TR avec l'adaptation
spécifique pour OS, induit un gain de rendement de 5.94% =
(4.64-4.38/4.38), et cela sur la base de l'information fournie par le biplot du
modèle AMMI1 (Figure 6.11).
107
L'étude du biplot du modèle AMMI2, construit en
utilisant les scores des génotypes et des sites
généré par les deux premières composantes, indique
que les sites OS et TR ont des scores opposés pour l'IPCA1, alors que
les sites KH et ST ont des scores opposés pour l'IPCA2. Les sites OS, KH
et ST sont une source d'interaction plus forte que celle du site de TR, comme
indiqué par les valeurs prises par leurs scores (Figure 6.12).
-1.000 -0.500 0.000 0.500 1.000 1.500 IPCA1 2.000
8
13
4
7
1
6
9
10
12
3
15 2
21
OS
ST
18
28
5
26
22
25
19
11
14
27
16
24
29
TR
30 17
23 20
KH
1.500
1.000
0.500
0.000
-0.500
-1.000
-1.500
Figure 6.12 : Biplot AMMI2 de l'interaction du rendement en
grains des 30 génotypes évalués dans 4
localités.
Les génotypes (Bichena / Ariza_2//Solga_8),
(Rascon/Sla_3/3/Plata_ 1/Snm//Plata_9), (Srn_3 / Nigris_4 // Porto_5),
(Plata_1/Snm // Plata_9/3/Green), (Altar84), (D68-1-93A-1A
//Ruff/Fg/3/Mtl-5/4/Lahn), (FI 02) et (Boussellem/Ofonto// waha) qui
représentent respectivement les numéros: 3, 8, 11, 14, 19, 21, 24
et 27, positionnés prés de l'origine, contribuent peu à
l'interaction G × L. Par contre les génotypes
(Gcn/4/D68-1-93A-1A//Ruff / Fg /3/ Mtl-5), (D68-1-93A-1A//Ruff /Fg /3/
Mtl-5/4/Lahn), (Minimus_7// Auk /Oste /3/ Shag_26), (MBB/Ofonto//Radiosso/
Waha), (Inter_9/Poho_1) et (Aram-5/Cali//Rascon-37/3/Plata-8) qui sont
représentés respectivement par les numéros: 12, 13, 6, 30,
16, et 22 contribuent
108
fortement à l'interaction (Figure 6.12). Les sites KH
et TR présentent le même type d'interaction, alors que les sites
de ST et OS présentent des types différents, vu qu'ils se
positionnent dans différents quadrants du biplot (Figure 6.12).
Le génotype Sula /RBCE_2/3/Hui //CIT
71/Cii/4/Ryps27_3/... (n°7) montre une adaptation spécifique au
site OS. Le génotype MBB/Ofonto//Radiosso/Waha (n°30) est
spécifiquement adapté au site du KH. Le génotype
Inter_9/Poho_1 (n°16) au site TR et le génotype
Aram-5/Cali//Rascon-37/3/Plata-8 (n°22) montre une adaptation
spécifique au site ST (Figure 6.12).
Sur la base des informations fournies par le biplot AMMI2,
l'adoption des génotypes à adaptation spécifique permet
d'exploiter l'interaction G x L et génère, par conséquent,
un gain de rendement égale à 0.64 t/ha = (4.28-3.64).
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