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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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2.3.Caractéristiques morphologiques des salmonelles

Les salmonelles sont des bacilles Gram négatif, mobiles péritriches à l'exception de Salmonella Gallinarumet Salmonella Pullorum(A. Andino & I. Hanning, 2015).

Les Salmonelles ont une paroi épaisse de 8 à 12 nm. En microscopie optique, elles apparaissent comme des bâtonnets à Gram négatif de 2 à 3 ìm de longueur et de 0,6 à 0,8 ìm de largeur. Le constituant le plus essentiel dans une membrane des bactéries à Gram-négatif, est un lipide complexe ; lipopolysaccharide (LPS). Celipopolysaccharide est un complexe macromoléculaire toxique présent de manière constitutive dans la membrane externe. (Avril et al., 1992). Les Salmonella sont des bactéries mobiles grâce à de fins filaments protéiques capilliformes : les flagelles. Ils présentent trois parties :

Un Filament hélicoïdal rigide de10um de longueur ;

Un crochet, très cours (60um) ;

Un corpuscule basal, il correspond à la zone d'insertion du flagelle dans le corps cellulaire. Cette structure est douée d'un pouvoir pathogène par l'intermédiaire de l'antigène flagellaire H, celui-ci est constitué de sous-unités protéiques : flagelline (Avril et al, 1992)

Elles sont aéro-anaérobies facultatives et se cultivent sur milieu ordinaire. Après des étapes de pré-enrichissement, d'enrichissement sélectif et de culture sur milieu, elles présentent après une incubation de 24 heures à 37°C, des colonies caractéristiques.

Ces colonies apparaissent roses à centre noir sur gélose Xylose Lysine Deoxycholate, incolores sur gélose Salmonella-Shigella et ambrées translucides sur gélose Eosine Methylene Blue (Nau et al., 2010 ; Jajere, 2019).

Figure 1 : Salmonella au microscope électronique

Source : http://microbiology.free.fr/Presentations/salmonella.pdf

2.4Taxonomie et nomenclature

Sur la base de tests phénotypiques et de tests sérologiques, Kauffmann, pionnier de l'analyse du genre Salmonella, avait individualisé plusieurs sous-genres et de très nombreuses espèces de Salmonella. Depuis quelques années sur le plan international, grâce aux études moléculaires basées sur l'analyse comparative des gènes codant les ARN ribosomaux et sur des techniques d'hybridation ADN-ADN, il fut proposé que le genre Salmonella soit subdivisé en deux espèces distinctes : Salmonella enterica, espèce majoritaire et Salmonella bongori. La première espèce est, elle-même subdivisée en 6 sous-espèces : enterica, salamae, Arizona, diarizonae, houtenae et indica (Grimont et al., 2000 ; Olsen, 2005). Chacune des sous-espèces est subdivisée en sérovars sur la base de caractères antigéniques, somatiques et flagellaires. L'association de ces facteurs antigéniques permet alors de définir une structure antigénique complète, qui selon le schéma de Kauffmann-White, caractérise une souche (Brisabois et al, 2016).

2.5 Habitat

La sous-espèce enterica comprend la plus grande majorité des souches isolées chez l'homme et les animaux à sang chaud ; les sous-espèces salamae, Arizona, diarizonae sont fréquemment retrouvées dans la flore commensale de l'intestin des animaux à sang froid mais peuvent être aussi isolées de l'environnement ou des animaux à sang chaud. Les sous- espèces houtenae, indica et l'espèce bongori sont très rarement retrouvées et n'ont pas d'habitats préférentiels (Brisabois et al, 2016). Bien que toute Salmonella isolée soit considérée comme potentiellement pathogène pour l'homme, la détermination du sérovar permet de mieux caractériser la souche et de la restituer dans son contexte écologique ou épidémiologique (Brisabois et al, 2016). Les Salmonella peuvent se multiplier à une température comprise entre 5°C à 45°C avec un optimum 35°C - 37°C, et à des pH de 4,5 à 9. L'optimum est entre 6,4 à 7,5. On peut diviser les Salmonella en trois groupes distincts : Les Salmonella spécifiques de l'homme : Salmonella Typhimurium ; Salmonella paratyphi A et Salmonella sendai responsables de fièvres typhoïdes et paratyphoïdes. Les sérovars adaptées à des espèces animales : Salmonella Gallinarumpullorum chez la volaille, Salmonella abortusovis chez le mouton, Salmonella abortuse chez le cheval, Salmonella Typhisuis et Salmonella choleraesuis chez le porc. Les autres sérovars sont ubiquistes et peuvent infecter aussi l'homme que l'animal et sont à l'origine de la plupart des salmonelloses humaines et animales.

Tableau II: Taxonomie de Salmonelle

Domaine

Bacteria

Phylum

Proteobacteria

Classe

Gammaproteobacteria

Ordre

Enterobacteriale

Famille

Enterobacteriaceae

Genre

Salmonella

EspecesBongori

Salmonella enterica et Salmonella

Sous-especes salmonella enterica :

Enterica, salamae, arizonae, diarizonae, houtenae et indica.

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