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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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v Diminution de la perméabilité de la membrane à l'antibiotique

La diminution delaperméabilité(mutationaffectantlastructuredesporinesou diminuantlasynthèsedesporines parlesquellesl'antibiotiquepeutpénétrerdanslabactérie)eteffluxactif :l'effluxreposesurunepompeinsérée danslamembraneetcapabled'éjecterl'antibiotiquehorsdelabactériegrâceuncanal ;ceteffluxconduitàune diminution dela concentration intracellulaire de l'antibiotique (Bimetet al., 2000 ; Cambau, 1997 ; Carbonelletal., 1987 ; Yang etal., 2009).

v modification de cibles

La modification de la cibledes antibiotiques : modification desPLP, les PLP ou "protéines liant les pénicillines" sontdesenzymesquicatalysentl'étapefinaledelabiosynthèsedupeptidoglycane(paroibactérienne)etquisont lacibledesbêta-lactamines(ensefixantauxPLPlesbéta-lactamineslesempêchentdejouerleurrôle ;la synthèse dupeptidoglycane est donc entravée). Trois mécanismes peuvent intervenir (Figure 9) :

a)diminutiondel'affinitédesPLPpourlesbêta-lactamines(Streptococcuspneumoniae;lesbéta- lactamines ont du mal à se fixer aux PLP qui restent disponibles pour la synthèse du peptidoglycane) ;

b) augmentation dela synthèse desPLPexistantes avec hyper-expression de PLPpossédant naturellementunefaibleaffinitépourlesbêta-lactamines(Enterococcusspp ;casprécédentavecenplus uneaugmentationdunombredePLPdisponiblespourlasynthèsedupeptidoglycanecequiconduitàune impossibilité pour une même dose de béta-lactamines de toutes les bloquer)

c)synthèsed'uneoudeplusieursnouvellesPLPinsensiblesauxbêta-lactamines(Staphylococcus aureus: l'acquisition et l'intégration dans le chromosome d'ungène(mecA), d'originemal connue, induitla synthèsed'unenouvelle PLP,laPLP2aqui est capable d'assurerà elle seulel'assemblagedu peptidoglycaneet elle confère une résistanceà toutes lesbêta-lactamines (Lozniewskia et Rabaud, 2010, Hedi et al., 2007).

Figure 5: Schéma récapitulatif des quatre types de stratégie de résistance à un antibiotique (Aarab et al., 2011).

v Excrétion par des systèmes d'efflux

Enfin, l'excrétion de l'antibiotique hors de la cellule : mécanisme rare. Bien entré dans la cellule, il en est chassé avant d'avoir pu agir. Ces différents mécanismes peuvent s'associer (Bimetetal., 2000 ; Cambau, 1997 ; Cattoir, 2004) (Figure 5).

Le système d'efflux actif est efficace grâce aux protéines transmembranaires ancrées dans la membrane plasmique mais également dans la membrane externe des bactéries Gram négatif). Ces protéines sont spécifiques d'une classe d'antibiotiques ou au contraire responsables de « multidrugresistance » (MDR). Pour fonctionner, les pompes à efflux utilisent l'énergie fournie par dissipation d'un gradient de protons (familles MFS, RND et SMR) ou d'ions sodium (famille MATE) ou encore par hydrolyse d'ATP (famille ABC) (Figure 5). En cas d'hyperexpression de ces systèmes, Chez les bactéries à Gram positif, les systèmes d'efflux ne sont constitués que d'une pompe transmembranaire. Chez les bactéries à Gram négatif, les systèmes d'efflux sont souvent des complexes protéiques ternaires avec une pompe transmembranaire, une protéine périplasmique de jonction et une porine de la membrane externe. Les pompes les plus fréquemment rencontrées sont de type RND comme AcrB chez Escherichia coliou MexB chez Pseudomonas aeruginosa(Cattoir, 2004). Lors d'une hyperexpression, ces systèmes d'efflux, comme celui correspondant aux gènes marRAB chez E. coli, entraîne une résistance généralement à bas niveau et croisée à différentes familles d'antibiotiques.

Figure 6 : Représentation schématique des cinq familles de pompes d'efflux d'après CATTOIR et al (2004)

MFS ou major facilitatorsuperfamily(ex. NorA chez Staphylococcus aureus) ; SMR ousmallmultidrugresistance(ex. EmrE chez Escherichia coli) ; MATE ou multidrug and toxic compound extrusion (ex. NorM chez Vibrio parahaemolyticus) ; RND ou resistance-nodulation cell division (ex. MexB chez Pseudomonas aeruginosa) avec MexA (membrane fusion protein) etOprM (outer membrane factor) ; ABC ou ATP-binding cassette (ex. LmrA chez Lactococcus lactis). ME, EP : membrane externe et espace périplasmique des bactéries à Gram négatif ; MC :membrane cytoplasmique ; ATB : antibiotique.

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