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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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Photo 7 : Centre Hospitalier Universitaire de la Mère et de l'Enfant

Les analyses moléculaires ont été réalisées au Laboratoire de Biochimie et Immunuologie Appliquer (LABIA) à l'Université Joseph Ki-Zerbo au Burkina Faso.

1.2. Typeet période d'étude

C'était une étude transversale descriptive qui a étéréalisée en deux phases de juin à Decembre2022( phase de collecte de données et d'analyse) et Janvier 2023 jusqu'à décembre 2023 (2émé phase d'analyse des données et redaction). Cette étude a concerné quatre (4) Hôpitaux des Districts Sanitaires (DS) et le CHU de la Mère et de l'Enfant de N'Djamena.

Photo 8 : Carte de la zone d'étude

1.3 Variables d'étude

Variables sociodémographiques et cliniques

L'examen clinique nous a permis :

ü noter la température corporelle fièvre supérieure ou égale à 38 ?C ;

ü d'apprécier l'état nutritionnel ,

ü l'existence ou non de signes de déshydratation ;

ü de rechercher des symptômes physiques associés

ü Age, sexe, profession, résidence, le nombre de selles émises par jour ;

ü l'aspect des selles ;

ü l'existence de traitement antérieur ;

ü début de la diarrhée, facteurs de risques associé à la diarrhée.

Variables paracliniques

Biologie :

ü Examen des selles et sang à la recherche du salmonella et shigella,

ü milieu de culture le gelosehektoene et hemoculture,

ü Test de sensibilité aux antibiotiques ,

ü Méthodes de réalisation d'antibiogramme (Kirby-Bauer , Préparation de la gélose Muller Hinton,

ü Choix des disques,

ü Lecture et interprétationetCaractérisation moléculaire.

1.4 Échantillonnage

Un échantillonnage exhaustif et consécutif de tous les patients de tous âges confondus hospitalisés ou non hospitalisés souffrant de diarrhées ou suspectés d'infections diarrhéiques reçus en consultation dans lesdifferentes structures sanitaires de notre zone d'etute a été réaalisé.

Les selles de routine et le sang des patients ont constitué notre échantillonnage. Mille cinquante (1050)echantillons des sellesprovenant des patients ont été reçus et mises en culture au LaboREDES et 320 sangs des patients qui ont une fièvre avec une temperaturesupérieure à 38° degrés. Les selles de routine ont été prélevées dans les flacons stériles chez les malades souffrant de troubles digestifs comme la diarrhée reçus au laboratoire du CHU ME ou soit prélevées dans les mêmes conditions chez les personnes souffrantes touché de troubles digestifs dans les hôpitaux des districts sanitaire de N'djamena dans des tubes stériles contenant de la gélose Cary-Blair pour des analyses au laboratoire de Bactériologie du LaboREDES.

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