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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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1.3.2 Procédure de collecte des données

Les données cliniques ont été recueillies sur une fiche de collecte de données réalisée à cet effet à l'aide d'un questionnaire présenté en face à face de l'enquêteur. La première partie de la fiche a été remplie à partir des dossiers et/ou à partir de l'interrogatoire de l'accompagnant (parents), concerne les principales variables qui sont : sociodémographiques des participants, les antécédents médicaux, les caractéristiques cliniques des patients et l'appréciation de la température corporelle. La deuxième partie concerne le laboratoire, aspect macroscopie des selles, microscopie à l'état frais et après coloration au Gram, les caractéristiques de la culture et les résultats de l'antibiogramme.

De chaque patient participant à l'étude, était prélevé un échantillon des selles pour faire la coproculture et les patients qui ont été soumis au test au thermomètre et qui présentaient une fièvre supérieure ou égale à 38 ?C, un prélèvement sanguin veineuse de 10 ml sera fait chez chaque patient consentant à l'étude, qui présentait une fièvre supérieure ou égale à 38 ?C et mis directement sur le flacon de l'hémoculture. Quant aux patients qui ont de diarrhée aiguë et qui ne sont pas sur le site ou on devrait faire l'analyse biologique seront prélevés par un écouvillon contenant un milieu physiologique à une température de conservation située entre 5 et 25°C susceptible de maintenir en vie les bactéries recherchées grâce à l'appui des agents de santé.

Une fois les prélèvements effectués, les échantillons ont été acheminés vers le laboratoire en vue de leur analyse. Les analyses ont été effectuées dès la réception des dits échantillons.

Photo 9 : Prélèvement des selles

1.3.3 Critère d'inclusion

Les selles ont été prélevées chez des patients tout venant et souffrant de troubles digestifs, reçus en consultation au CHU ME et dans les quatre hôpitaux des districts de N'Djamena Tchad. Chaque personne incluse dans l'étude a fait l'objet de prélèvement des selles dans un flacon stérile ou écouvillons et présentant une fièvre supérieure à 38 ?C ayant été hospitalisés ou ayant été reçus en consultation externes, précédent leur consultation à l'une des quatre hôpitaux des districts et le CHU de la mère et de l'enfant de la ville de N'Djamena étaient éligibles pour participer à l'étude.

Les patients ont été exclus de notre étude : tous les selles provenant des personnes sans trouble digestifs, les patients ne présentant une fièvre supérieure à 38 ?C lors de la consultation et les personnes ayant prélevées des selles dans de conditions non appropriées.

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