1.4 Analyses microbiologiques
et moléculaires
L'écouvillon, le pot et le flacon de
l'hémoculture étaient acheminés immédiatement au
Laboratoire CHU de la mère et de l'enfant et au laboratoire de recherche
diagnostic et expertise scientifiques (LABO-REDES) ont
étéimmédiatement traités.
Deux méthodes ont été utilisées
pour réaliser les analyses microbiologiques : les méthodes
manuelles de coproculture avec la galerie API 20E et la méthode de
l'hémoculture.
L'isolement, l'identification culturale, la
caractérisation biochimique, les tests sérologiques et la
conservation des souches ont été effectuées au Centre
Hospitalier Universitaire Mère et enfant et le LaboREDES N'Djamena
(Tchad). La caractérisation moléculaire des souches des
Salmonella a été réalisée au Labia Burkina
Faso.
1.4.1
Enregistrement des selles
Les selles ont été reçues des malades
hospitalisés dans des services du CHU ME et de malades externes venant
des différents quartiers de N'Djamena et les quatre hôpitaux des
districts de Ndjamena pour des consultations médicales.. Chaque selle
reçue a été étiquetée conformément au
numéro d'ordre dans le registre de coproculture et ensuite codé.
Les flacons stériles, hermétiques et parfois munis d'une
cuillère ou d'une spatule ont été recommandés pour
le prélèvement et l'ensemencement plus pratique. On
prélève à partir des matières fécales
émises dans un récipient propre, quelques grammes de selles. Un
fragment muco-purulent ou sanguinolent est choisi lorsqu'il existe.
Les selles de routines ont été recueillies dans
des flacons stériles chez les patients reçus au laboratoire du
CHU ME.
L'écouvillonnage se fait à l'aide d'un
dispositif formé d'un écouvillon stérile et d'un tube en
plastique contenant de l'eau physiologique stérile à 0.9%.
Figure 10: Ecouvillonnage humide
1.4.2 Examen macroscopique
Chaque selle reçue a été soumise à
un examen macroscopique pour la description de leurs aspects et consistance
1.4.3. Examen microscopique
1.4.3.1. Recherche de la
mobilité et morphologie
L'état frais se fait également pour
l'observationde la mobilité et de la morphologie des germes .
2.5 Analyses
microbiologiques
Une méthode a été utilisée pour
réaliser les analyses microbiologiques. La méthode manuelle avec
la galerie API® 20E, et les milieux d'isolement.
1.5.1 Méthodes Manuelles de Coproculture
1.5.2. Traitement des échantillons
La mise en culture des différents milieux, passe par
l'ensemencement de ces milieux (enrichissement, isolement).
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