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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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4.2 Profil de résistance aux antibiotiques des Salmonella et Shigella isolés

La résistance des bactéries, particulièrement les entérobactéries aux antibiotiques constitue un véritable problème de santé publique. Cette résistance affecte aussi bien les pays développés que les pays en développement où cohabitent l'automédication et la vente anarchique des médicaments en dehors des structures légales (Aminov, 2010). Dans les pays en voie de développement, les gastro-entérites sont endémiques et constituent un problème majeur de santé publique, particulièrement chez les enfants de 0 à 5 ans (Dembélé et al., 2016). Les antibiotiques de première intention pour leur traitement sont les phénicolés (chloramphénicol), les â-lactamines (amoxicillines, ceftriaxones) et les sulfamides (sulfamétaxazole-triméthoprime) (Aubry et Güzère, 2015). Ces dernières années, en particulier dans les zones tropicales l'incidence desalmonella et shigella multi-résistantes aux antibiotiques a vite augmenté. Les â-lactamines (les aminopénicillines, les céphalosporines, les monobactam et les carbapénèmes) constituent la famille des antibiotiques les plus utilisées (Ouédraogo et al., 2017). La mauvaise utilisation de ces antibiotiques a rapidement conduit à la croissance de la résistance accrue de ces antibiotiques.

L'étude de la sensibilité des agents bactériens aux antibiotiques a impliqué l'évaluation de l'efficacité de différentes familles d'antibiotiques, notamment les bêta-lactamines (comme l'ampicilline et la ceftriaxone), le chloramphénicol, les cyclines (tels que la doxycycline), les sulfamides (comme le cotrimoxazole) et les fluoroquinolones (telles que la ciprofloxacine). Cette évaluation a été menée de manière rigoureuse, conformément aux protocoles établis par Quilici et ses collaborateurs en 2010 ainsi que par le Comité de l'Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie en 2022.

Cette étude a contribué en fournissant des données sur l'antibiorésistance des isolats de Salmonella et Shigella provenant des quatre hôpitaux de district de N'Djamena. La proportion de souches de Salmonella résistantes s'élevait à 66,66%. Ces résultats sont en accord avec ceux de l'étude menée par Dembélé et ses collègues en 2020 au Burkina Faso, qui ont également constaté un taux de résistance dépassant 50%.

La majorité des souches isolées dans notre étude ont démontré une résistance aux bêta-lactamines (ampicilline, amoxicilline) à un taux d'environ 75%.

Ces résistances pourraient apparaitre naturellement dans le temps, généralement à la suite de modifications génétiques. Toutefois la prescription ou l'usage démesuré de ces antibiotiques ainsi que le non-respect des délais de traitement pourraient être la cause de l'accélération de ce processus de résistance. Ces résistances pourraient également être justifiées par le phénomène de l'automédication.

Mais une tres bonne sensibilité a été observé chez le famille de quinolone élevée à (82%) pour le ciprofloxacine et (80%) pour acide nalidixique. Ces résultats montrent que les quinolones restent toujours de très bonne alternative pour le traitement des maladies diarrhéiques dues aux salmonella et shigella. Selon les directives de l'Organisation Mondiale de la Santé, la ciprofloxacine est un antibiotique de choix pour tous les patients présentant une diarrhée aigue (Yang et al., 2013).

Des travaux anterieur au Burkina Faso ont été faite par Ouedrago et al en 2021ont trouvé les isolats de Salmonella spp. ont montré des taux de résistance allant de 00 % (à l'imipénème et à l'acide nalidixique) à 100 % (à l'amoxicilline + acide clavulanique et à la colistine) pour les isolats cliniques et de 00 % (à l'imipénème) à 100 % (ciprofloxacine amoxique) pour les isolats environnementaux.

De telles résistances observées seraient dues à la production d'une pénicillinase associée à une céphalosnase ou une â-lactamases à spectre élargi capable de résister à tous les antibiotiques de la famille de â-lactamine à l'exception de l'imipénème (Zeba et al., 2007, Duval, 1999, Haukkak, 2007, Carvallo, 2004).

En effet, les salmonella et shiegella sont sensibles à l'Imipénème, ce qui justifie sa place en premier choix dans le traitement des infections sévères à bactéries multirésistantes.

Cette hausse de la résistance aux antibiotiques pourrait être attribuée à divers facteurs tels que l'automédication, l'utilisation d'antibiotiques en agriculture et en élevage, ainsi que des pratiques de prescription inadéquates et la circulation des medicaments de mauvaise qualités.

La résistance croisée a également été observée dans cette classe d'antibiotiques, touchant des souches des genres Shigella, Salmonellaet Escherichia, qui sont naturellement peu sensibles. Cette résistance, lorsqu'elle se manifeste, est généralement associée à la production de bêta-lactamases telles que les pénicillinases, les céphalosporinases et les carbapénémases par les souches concernées, comme indiqué dans plusieurs études (Zeba et al., 2007 ; Duval, 1999 ; Haukka et Siitonen, 2007 ; Cavallo, 2004). De plus, en France, Courvalin et Philippon (1989) ont démontré que le transfert des plasmides contenant ces déterminants est un mécanisme clé dans la propagation de la résistance aux antibiotiques.

Ces travaux antérieurs apportent un soutien supplémentaire à notre étude, en particulier en ce qui concerne les tests de sensibilité aux antibiotiques. Cela renforce la fiabilité et la pertinence de nos résultats dans le contexte plus large de la recherche sur la sensibilité des agents bactériens aux médicaments antimicrobiens.

En effet au Tchad, deux raisons peuvent expliquer le taux de résistance de E. coli à la ciprofloxacine : la première raison est que la prescription de l'antibiotique par le clinicien se fait avant toute analyse au laboratoire. Les antibiotiques sont prescrits de façon empirique. La seconde raison est la large utilisation des antibiotiques de la rue due à la pauvreté et à l'ignorance. La plupart des médicaments sont vendus par des personnes non qualifiées.

Donc une nouvelle attitude thérapeutique devra être adoptée dans les années à venir pour réduire l'inefficacité de cet antibiotique.

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