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Epidemiologie et caracterisation moleculaire de salmonella et shigella, chez les patients souffrants de diarrhée aiguë à  N'Djamena au Tchad


par N'gare Hassan Mahamat Tahir
Université de N'Djamena - Doctorat en Biologie 2025
  

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Liste des figure

Figure 1 : Salmonella au microscope électronique........................................................15

Figure2: Shigella sonnei (cliché Wadsworth center, 2007)...............................................34

Figure3:Généralités sur les entérobactéries.................................................................35

Figure 4 : modification morphologique d'une souche Bactérienne............................................46

Figure 5: Schéma récapitulatif des quatre..................................................................47

Figure 6 : Représentation schématique des cinq familles de pompes d'efflux............................48

Figure7; : Centre Hospitalier Universitaire de la Mère et de l'Enfant.............................................51

Figure8;Carte de la zone d'étude..............................................................................52

Figure 9. Prélèvement des selles.............................................................................54

Figure 10 : Ecouvillonnage humide..........................................................................55

Figure11 : pré-enrichissement dans RV avant 24h et après 24h.........................................56

Figure12:RV isolé sur gélose Kektoen.....................................................................57

Figure 13: Hemoculture Negative...........................................................................60

Figure 14: Hemoculture Positive............................................................................60

Figure 15: Salmonella typhi sur Hektoene colonies vertes au centre noir...............................70

Figure 16 : Shigella sur Hektoene colonies vertes transparents..........................................71

Figure17: identification sur galerie API 20 E Salmonella typhi differenciation biochimique.......71

Figure18:identification sur galerie API 20 E Shigella flexneri différenciation biochimique.........71

Figure 19 : Répartition mensuelle des cas de diarrhées et agents bactériens isolé....................72

Figure20:Distribution des germes isolé dans les hôpitaux de districts et CHU ME...................73

Figure 21 : Migration des réplicons de salmonella........................................................80

Figure 22: Dendrogramme basé sur des empreintes de (GTG)5-PCR sur les souches cliniques de Salmonellaselon l'algorithme de l'UPGMA...............................................................81

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Liste des tableaux

TableauI:Mode de transmission de certaines infections bactériennes.................. ;..............11

Tableau II:Taxonomie de Salmonelle ......................................................................17

TableauIII:Pouvoir Pathogène des Salmonella isolé chez l'homme et les animaux..................18

Tableau IV : Description des principales épidémies d'origine alimentaire dues à Salmonella....................................................................................................................24

Tableau V : Distribution des cas confirmés de salmonelloses par serovars chez les humains, 2008-2009 (EFSA Journal, 2011....................................................................................25

Tableau VI : Répartition des 15 sérotypes de Salmonella humains les plus fréquents isolés de quelques pays africains en nombre et en pourcentage ((Hendriksen et al., 2011))....................26

TableauVII:Sérotypes de Salmonella isolés à N'Djamena au Tchad ..................................27

TableauVIII :caractères biochimiques différentiels des entérobactéries pathogènes.................57

TableauIX :Disques des antibiotiques choisis pour les tests de la sensibilité...........................61

TableauX : Répartition des patients selon l'âge et la provenance.........................................69

TableauXI :Aspects et consistance des selles selon l'âge.................................................70

Tableau XII : Répartition des agents bactériens selon le sexe............................................73

Tableau XIII :Analyse de l'efficacité des 14 antibiotiques face aux agents bactériens isolés......76

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