Diagnostic précoce du VIH-1 chez les enfants nés des mères séropostives par RT/PCR au laboratoire de virologie du centre Muraz.

REMERCIEMENTS

Ce travail est l'aboutissement de la contribution de plusieurs personnes auxquelles nous tenons à exprimer notre profonde gratitude. Il sied de remercier particulièrement :

ü Le révérend père Édouard ADE, président de l'Université Catholique de l'Afrique de l'Ouest/ Unité Universitaire à Bobo-Dioulasso (UCAO/UUB) ;

ü Dr Dramane KANIA, PharmD, MSc, PhD, Directeur scientifique et Technique du Centre MURAZ, mon professeur de virologie au semestre 3, merci de m'avoir donné le goût de la virologie et d'avoir accepté de diriger mon travail malgré vos multiples occupations. Surtout mes sincères remerciements, J'espère avoir été à la hauteur de vos attentes et soyez assurés de ma profonde reconnaissance ;

ü Aux membres du jury, pour l'effort consenti à apporter leur contribution à notre travail en le jugeant ;

ü Dr Amariane OUATTARA, responsable du laboratoire de Biologie clinique du Centre MURAZ, nous vous remercions de nous avoir permis de réaliser notre stage auprès de vous ;

ü A tous le corps professoral et administratif de l'UCAO/UUB pour la qualité de l'enseignement reçu ;

ü A Mlle Viviane NIKIEMA, KADEBA Franck Edgar,YOUSSOUF adam cherifpour leur disponibilité et pour le temps qu'ils m'ont consacré tout au long de mon stage. J'ai beaucoup appris d'eux ;

ü Aux Dr Thérèse KAGONE,Moumouni NOCTARApour les conseils et le soutient que j'ai reçu d'eux au fil des jours de mon stage ;

ü Tous nos promotionnaires de la licence 2019-2020. Ce fut un plaisir et une chance de vous avoir à nos côtés tout le long du parcours. Grand merci à vous pour cette attache familière et la marque de sympathie, pour vos conseils ainsi que vos encouragements.

Table des matières

DEDICACE I

REMERCIEMENTS II

LISTE DES ILLUSTRATIONS V

LISTE DES ABREVIATIONS ET SIGLES VI

PREAMBULE VII

RESUME VIII

ABSTRACT IX

INTRODUCTION 1

PREMIERE PARTIE : GENERALITES 4

I.GENERALITES SUR LE VIRUS DE L'IMMUNODEFICIENCE HUMAINE 5

I.1. Le virus de l'immunodéficience humaine 5

I.1.1 Historique 5

I.1.2. Données épidémiologiques 5

I.1.3. Mode de contamination 6

I.1.4. Taxonomie et diversités génétiques du VIH 7

I.1.5. Structure et organisation génomique du VIH 8

I.1.6. Les marqueurs du VIH et leurs évolutions 10

I.1.7. Histoire naturelle du VIH. 11

I.1.8. Physiopathologie des infections du VIH 12

I.1.9. Prévention 14

I.1.10. Traitement 14

I.2.Diagnostic biologique 17

I.2.1. Diagnostic sérologique (indirect) 17

I.2.2. Diagnostic moléculaire (direct) 18

II. Diagnostic du VIH-1 chez les enfants 19

II.1. Diagnostic de l'infection à VIH-1 chez le nouveau-né 19

II.2. Diagnostic de l'infection à VIH-1 au-delà de l'âge de 18 mois 20

DEUXIEME PARTIE : ETUDE EXPERIMENTALE 22

I.METHODOLOGIE 23

I.1.Cadre d'étude 23

I.2.Types et périodes d'étude 23

I.3. Population d'étude 23

I.3.1. Critères d'inclusion 24

I.3.2. Critères de non inclusion 24

I.4.Echantillonnage 24

I.5. Recueil des données 24

I.6.Traitement et analyse des données 24

I.7.Définitions opérationnelles 25

I.8. Matériel de laboratoire utilisé 25

I.8.1. Réactifs 25

I.8.2. Appareillage 27

I.8.3. Autres matériel 28

I.8.4. Consommables/accessoires 28

I.9. Analyses au laboratoire 28

I.9.1. Prélèvement 28

I.9.2. Préparation des échantillons 29

I.9.3. Technique d'extraction et d'amplification de l'ADN-VIH 29

II. RESULTATS 30

II.1. Caractéristiques sociodémographiques des enfants 30

II.1.1. L'âge des enfants de l'étude 30

II.1.2. Répartition selon le sexe 31

II.2. Répartition selon la prophylaxie ARV des enfants 31

II.3. Répartition des enfants selon le type d'allaitement 31

II.4. Traitement ARV de la mère pendant la grossesse 32

II.5. Prophylaxie ARV de la mère au moment de l'accouchement 32

II.6. Résultats des analyses au laboratoire 33

II.6.1. Résultats PCR en fonction de l'âge des enfants exposés au VIH 33

II.6.2. Résultats PCR en fonction de la prophylaxie ARV de l'enfant 33

II.6.3. Résultats PCR en fonction du type d'allaitement 34

II.6.4. Résultats PCR de l'enfant en fonction du traitement de la mère 35

II.6.5. Résultats PCR de l'enfant en fonction de la prophylaxie de la mère 35

III. DISCUSSION 36

CONCLUSION 38

RECOMMANDATIONS 38

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES 39

ANNEXES i